Sağlık Bilimleri Enstitüsü / Institute of Medical Sciences
Permanent URI for this communityhttps://hdl.handle.net/11452/17
Browse
Browsing by Author "0000-0001-5209-254X"
Now showing 1 - 1 of 1
- Results Per Page
- Sort Options
Item Klinik örneklerden izole edilen mucorales takımı mantarların tür dağılımı ve antifungal duyarlılıklarının retrospektif olarak belirlenmesi(Bursa Uludağ Üniversitesi, 2023-10-19) İkkan, Ayşen; Ener, Beyza; Bursa Uludağ Üniversitesi/Sağlık Bilimleri Enstitüsü/Tıp Fakültesi/Tıp-Mikrobiyoloji Anabilim Dalı.; 0000-0001-5209-254XMukormikoz genellikle bağışıklık sistemi baskılanmış hastalarda görülen Mukorales takımı mantarların sebep olduğu bir mantar enfeksiyonudur. Tanısı zor, mortalitesi yüksek ve dünya çapında nadir görülmektedir. İnsidansı tam olarak bilinmemektedir, çünkü popülasyona dayalı az çalışma bulunmaktadır. Bu çalışma ile, Mucorales suşlarının tür tanımlaması morfolojik özellikleri ve MALDI TOF MS ile yapılıp ITS bölgesi ile karşılaştırılmıştır. Bu suşların antifungal duyarlılık profillerine bakılarak ülkemiz için ilk tek merkezli epidemiyolojik veri elde edilmiştir. Bu çalışmada, Bursa Uludağ Üniversitesi Sağlık Uygulama ve Araştırma Merkezi, Merkez Mikrobiyoloji (Mikoloji) Laboratuvarına 2003 ile 2022 tarihleri arasında gelen ve -80oC’da saklanan, ayrı hastalara ait 87 Mucorales suşu kullanıldı. ITS bölgesiyle tanımlama amacıyla sadece referans suşlarla BLAST analiz yapıldı ve oldukça net kurallar kullanıldı. Bu suşlardan 77’si ITS bölgesiyle tanımlandı ve en fazla Rhizopus türleri (%75,3) saptandı. Ancak 10 izolat ITS bölgesi ile tanımlamadı. Tanımlama yetersizliği %5,7 oranında olduğu düşünüldü. Tüm suşlarda cins düzeyinde moleküler tanımlama ile tam uyum sağlanmıştır. MALDI TOF MS ile tanımlamada katı ve sıvı besiyerinden ekstraksiyon arasında tür açısından bir fark olmamakla beraber sıvı ekstraksiyon yöntemi anlamlı bir şekilde daha başarılı bulunmuştur. Tür tanımlanması tam yapılmış 77 suşun, in vitro antifungal duyarlılıkları, CLSI M38 referans yöntem ile belirlendi. Posakonazol direnci saptanmamış ancak amfoterisin B direnci Rhizopus arrhizus suşlarında düşük oranda olsa da görülmüştür. Sonuç olarak bu çalışmada merkezimizde en sık izole edilen türün R. arrhizus olduğu, MALDI TOF MS tanımlamanın sıvı ekstraksiyon yöntemi kullanıldığında oldukça başarılı olduğu ve izolatlarımızda ciddi bir antifungal direncin olmadığı saptandı.