Browsing by Author "Balta, Fikri"
Now showing 1 - 6 of 6
- Results Per Page
- Sort Options
Item Balık ve yetiştirme suyu kökenli Aeromonas izolatlarının antimikrobiyal duyarlılıklarının saptanması(Ankara Üniversitesi, 2017) Onuk, Ertan Emek; Yeliz, Tanrıverdi Çaycı; Çoban, Ahmet Yılmaz; Çiftçi, Alper; Balta, Fikri; Didinen, Behire Işıl; Altun, Soner; Uludağ Üniversitesi/Veteriner Fakültesi/Su Ürünleri Hastalıkları Anabilim Dalı.; 0000-0001-9096-875X; AAG-8518-2021; 56269221600Aeromonas türleri sucul ortamda yaygın olarak bulunan ve hem soğuk kanlı hayvanlarda hem de insanlar da çeşitli hastalıklara neden olabilen Gram negatif basillerdir. Bu çalışma, ülkemizde balık ve yetiştirme sularından izole edilmiş olan Aeromonas izolatlarının antimikrobiyal duyarlılık profillerinin belirlenmesi amacıyla gerçekleştirildi. Çalışmaya üç farklı coğrafik bölgeden (Karadeniz, Akdeniz, Ege) izole edilmiş olan toplam 45 Aeromonas izolatı (20 A. sobria, 10 A. hydrophila, dokuz A. salmonicida, dört A. bestiarum, iki A. veroni) dahil edildi. İzolatların 13 farklı antimikrobiyal ajana karşı antimikrobiyal aktiviteleri disk difüzyon yöntemiyle değerlendirildi. Test edilen antimikrobiyaller içerisinde gentamisin bütün izolatların duyarlı olduğu tek antimikrobiyal olarak belirlendi. Florfenikol ve siprofloksasin’in yüksek düzeyde etkin oldukları (direnç oranı %8.9), en düşük duyarlılık oranın ise amoksisilin (%17.8), ampisilin (%22.2) ve oksolonik asit’e (%35.6) karşı şekillendiği belirlendi. Sonuç olarak, çalışmada farklı oranlarda ilaç direncinin saptanmış olması hem balık hem de insan hastalıklarının tedavisinde uygun antimikrobiyel ajanların seçilmesinin önemini ortaya koymakla birlikte Aeromonas türleri için etkin ulusal antimikrobiyal direnç izleme sistemlerine ihtiyaç duyulduğunu göstermektedir.Publication Detection of The First QnrS gene positivity in Aquatic Aeromonas spp. Isolates in Turkey (vol 49, pg 114, 2015)(Ankara Microbiology Society, 2015-04-01) Onuk, Ertan Emek; Caycl, Yeliz Tanrıverdi; Çoban, Ahmet Yılmaz; Çiftçi, Alper; Balta, Fikri; Didinen, Behire Işıl; Pekmezci, Gökmen Zafer; Altun, Soner; Ünlü, Mehtap Söğüt; Deveci, Aydın; ALTUN, SONER; 0000-0001-9096-875X; AAG-8518-2021Item Development and validation of glycoprotein-based native-subunit vaccine for fish against Aeromonas hydrophila(Wiley, 2016-08) Çiftci, Alper; Onuk, Ertan Emek; Çiftci, Gülay; Fındık, Arzu; Söğüt, Mehtap Ünlü; Didinen, Behire Işıl; Aksoy, Abdurrahman; Üstünakın, K.; Gülhan, Timur; Balta, Fikri; Altun, Soner; Uludağ Üniversitesi/Veteriner Fakültesi/Su Hayvanları Hastalıkları Anabilim Dalı.; 0000-0001-9096-875X; AAG-8518-2021; 56269221600Aeromonas hydrophila is known to be causative agent of an infection named as Bacterial haemorrhagic septicaemia or red pest in freshwater fish. The aim of this study was to develop and validate the glycoprotein-based fish vaccine against Aeromonas hydrophila. For this aim, after identification and characterization of A. hydrophila isolates from fish farms, one A. hydrophila isolate was selected as vaccine strain. Antigenic glycoproteins of this vaccine strain were determined by Western blotting and glycan detection kit. The connection types of these glycoproteins were examined by glycoprotein differentiation kit. Two glycoproteins, molecular weights of 19 and 38 kDa, with SNA connection type were selected for use in vaccination trials. After their purification by SNA-specific lectin and size-exclusion chromatography, protection studies with purified proteins were performed. For challenge trials, four experimental fish groups were designated: Group I (with montanide), Group II (with montanide and ginseng), Group III [with Al (OH) 3] and Group IV [with Al(OH) 3 and ginseng]. The survival ratings of fish were determined, and protection was calculated as 21.56%, 29.41%, 69.83% and 78.88% in groups I, II, III and IV, respectively. In conclusion, A. hydrophila glycoproteins with Al(OH) 3 and ginseng could be used as a safe and effective vaccine for fish.Item Molecular characterization and antimicrobial resistance profile of atypical Citrobacter gillenii and Citrobacter sp. isolated from diseased rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)(Elsevier, 2017-05-12) Balta, Fikri; Duman, Muhammed; Satıcıoğlu, İzzet Burçin; Büyükekiz, Ayşe Gül; Altun, Soner; Uludağ Üniversitesi/Veteriner Fakültesi/Su Hayvanları Hastalıkları Anabilim Dalı.; 0000-0001-9096-875X; 0000-0002-2721-3204; 0000-0001-7707-2705; 0000-0003-2124-9406; AAG-8518-2021; AAD-4156-2019; T-1697-2019; 55568071100; 57194590388; 55567777200; 56269221600Aim: Over the last decade, Citrobacter species have been responsible for infections in fish and many species and also new Citrobacter species have been identified. In this study, molecular identifications and the phenotypic and genotypic antimicrobial-resistance characteristics of atypical and typical Citrobacter species were determined. Materials and methods: Seven Citrobacter isolates were investigated from rainbow trout of different lengths with signs of disease. Biochemical characteristics were determined using conventional tests and rapid test kits; moreover, molecular identifications were conducted with 16S rRNA and the gyrB housekeeping gene region. The sequencing results obtained from the gyrB gene region were deposited in the GenBank database and compared with isolates from different countries that were registered in the database. Resistances to florfenicol, sulfonamides, and tetracycline antimicrobials were determined using the broth micro dilution method, and molecular resistance genes against these antimicrobials were identified. All detected resistance genes were confirmed by sequence analyses. Results: It was determined that three of the Citrobacter species with biochemical characteristics were atypical and showed oxidase-positive reactions. All the Citrobacter species were identified as Citrobacter sp. using the 16S rRNA gene; three isolates were identified as Citrobacter gillenii and four as Citrobacter sp. based on gyrB gene sequence analysis. Some isolates were found in the same group as other countries' isolates in the GenBank database, while isolates with high identities were found in different genogroups. All isolates were found to be phenotypically resistant to sulfamethoxazole and susceptible to tetracycline; these isolates' resistance genes included sulI, tetA, tetB, and tetD.Item Phenotypic and molecular characterization of Yersinia ruckeri isolates from Rainbow Trout (Oncorhynchus mykiss, Walbaum, 1792) in Turkey(Schluetersche Verlagsgesellschaft, 2011) Onuk, Ertan Emek; Çiftçi, Alper; Çiftçi, Gülay; Fındık, Arzu; Balta, Fikri; Özer, Selmin; Çoban, Ahmet Yılmaz; Altun, Soner; Uludağ Üniversitesi/Veterinerlik Fakültesi/Mikrobiyoloji Anabilim Dalı.; 0000-0001-9096-875X; AAG-8518-2021; 56269221600The aim of the study was the phenotypic and molecular characterization of Yersinia (Y.) ruckeri strains, the causative agent of Enteric Red mouth Disease (ERM), by antibiotyping, random amplified polymorphic DNA-polymerase chain reaction (RAPD-PCR) and sodium dodecylsulphate-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) patterns of whole cell proteins. For this aim, a total of 97 Y ruckeri isolates were analyzed. The isolates were distinguished into ten antibiotypes and six phenotypes according to their resistance properties and whole cell protein profiles, respectively. Also, a glycoprotein band of approximately 25.5 kDa was observed in all Y ruckeri strains tested. In all strains, six different RAPD types were observed. In conclusion, Y ruckeri strains isolated from rainbow trout of fish farms in Turkey showed variation according to their phenotypic and genotypic characteristics, and the use of these three typing techniques in double and triple combinations could be more useful for discriminating the strains.Item Türkiye’de su kaynaklı aeromonas spp. izolatlarında saptanan ilk QnrS gen pozitifliği(Ankara Mikrobiyoloji Bülteni, 2015-01) Onuk, Ertan Emek; Caycı, Yeliz Tanrıverdi; Çoban, Ahmet Yılmaz; Çiftçi, Alper; Balta, Fikri; Didinen, Behire Işıl; Ünlü, Mehtap Söğüt; Deveci, Aydın; Altun, Soner; Bursa Uludağ Üniversitesi/Veteriner Fakültesi/Klinik Öncesi Bilimler/Su Ürünleri Hastalıkları Bölümü.; 0000-0001-9096-875X; AAG-8518-2021; 56269221600Sularda yaygın olarak bulunan Aeromonas türleri, gram-negatif, oksidaz pozitif, fakültatif anaerop bakteriler olup, A.hydrophila, A.sobria ve A.bestiarum türleri hem insanlarda hem de soğukkanlı hayvanlarda ciddi enfeksiyonlara neden olmaktadır. Tıp ve veterinerlik alanında yaygın olarak kullanılan kinolonların çevresel ortamlarda değişmeden kalabilme özelliği, dirençli mutantların seçiminde önemli rol oynamaktadır. Plazmid aracılı direnç, kinolonlara karşı direncin gelişiminde etkin olan mekanizmalardan biri olup, qnr, qepA, aac(6’)-Ib-cr ve oqxAB genleri direnç determinantları olarak tanımlanmıştır. Birçok farklı qnr determinantının, başta Enterobacteriaceae ailesi olmak üzere çeşitli bakterilerde saptanması, bu yapıların doğada bulunabileceğini vurgulamaktadır. Yakın zamanda sudan izole edilmiş Aeromonas spp. izolatlarında plazmid aracılı kinolon direnci tespit edilmiştir. Bu çalışmanın amacı, ülkemizde sukaynaklı Aeromonas suşlarında qnr gen varlığının araştırılmasıdır. Çalışmaya, Türkiye’nin üç farklı coğrafi bölgesindeki (Ege, Akdeniz ve Karadeniz) balık ve sulardan izole edilmiş toplam 45 Aeromonas spp. izolatı dahil edilmiştir. İzolatların tür düzeyinde tanımlanması 16S rDNA-RFLP (Restriction fragment length polymorphism) ve multipleks polimeraz zincir reaksiyonu (M-PCR) ile yapılmış ve 20 suş A.sobria, 10 suş A.hydrophilia, 9 suş A.salmonicida, dört suş A.bestiarum ve iki suş A.veronii olarak tanımlanmıştır. Plazmid aracılı kinolon direnç genlerinden qnrA, qnrB, qnrC ve qnrS genlerinin varlığı M-PCR ile araştırılmış; qnr pozitif olarak saptanan dokuz izolata dizi analizi uygulanmıştır. Dizi analizi sonucuna göre, altı A.sobria, iki A.bestiarum ve bir A.hydrophila izolatında (9/45; %20) qnr varlığı tespit edilmiş; bu gen GenBank veri tabanı ile karşılaştırıldığında qnrS2 olarak tanımlanmıştır. Tüm qnrS2 pozitif Aeromonas izolatları siprofloksasine duyarlı olarak saptanırken, beş izolat nalidik aside dirençli bulunmuştur. Bu çalışma, ülkemizde su kaynaklı Aeromonas türlerinde plazmid aracılı kinolon direncinin araştırıldığı ve qnrS2 varlığının tespit edildiği ilk çalışma olma özelliğini taşımaktadır. Sonuç olarak, su kaynaklı mikroorganizmalardaki farklı direnç genlerinin diğer bakterilere ve klinik izolatlara aktarılmasının, enfeksiyonların tedavisinde potansiyel bir risk oluşturacağı düşünülmüştür.