Browsing by Author "Uğraş, Nesrin"

Now showing 1 - 20 of 31

A mimicker of gallbladder carcinoma: Cystic gastric heterotopia with intestinal metaplasia
(De Gruyter Poland Sp Zoo, 2017-01-01) BALABAN ADIM, ŞADUMAN; Özgün, Gonca; Balaban Adım, Şaduman; Uğraş, Nesrin; KILIÇTURGAY, SADIK AYHAN; UĞRAŞ, NESRİN; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Patoloji Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Genel Cerrahi Anabilim Dalı.; AAH-2716-2021; KGL-6139-2024
Heterotopic gastric mucosa in the gallbladder is an unusual entity and is usually clinically silent. We report a 75-year-old female patient who presented with intermittent upper abdomial pain radiating to the back. Abdominal imaging studies showed a sessile polypoid lesion and a gallstone in the gallbladder. Gallbladder carcinoma was suspected and cholecystectomy performed. Intraoperative frozen section examination suggested mucinous tumor, suspicious for malignancy. However, the permanent sections revealed aberrant gastric tissue consisted of gastric pyloric and fundic glands of heterotopic gastric mucosa with intestinal metaplasia in the gallbladder.
An incidental unique mediastinal mass in an asymptomatic young patient: Thymolipoma
(Turkish Assoc Tuberculosis & Thorax, 2013-01-01) Uğraş, Nesrin; Akyıldız, Elif Ülker; Ünal, Nermin; Bayram, Ahmet Sami; UĞRAŞ, NESRİN; AKYILDIZ, ELİF ÜLKER; Ünal, Nermin; BAYRAM, AHMET SAMİ; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Patoloji Anabilim Dalı.; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Göğüs Cerrahisi Anabilim Dalı.; 0000-0003-0684-0900; ABB-7580-2020; AAH-2716-2021; JHY-9777-2023; CDS-3138-2022
Association of adiponectin receptor (Adipo-R1/-R2) expression and colorectal cancer
(Asian Pacific Organization Cancer Prevention, 2014) Ayyıldız, Talat; Dolar, Enver; Uğraş, Nesrin; Adım, Şaduman Balaban; Yerci, Ömer; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/İç Hastalıkları Anabilim Dalı.; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Tıbbi Patoloji Anabilim Dalı.; AAG-9177-2021; AAH-2716-2021; 6602075084; 55386535600; 15730076300; 6603810549
Introduction: Human adiponectin (ApN) is a 30 kDa glycoprotein of 244-amino acids which is extensively produced by adipocytes. ApN acts via two receptors, namely adiponectin receptor-1 (Adipo-R1) and adiponectin receptor-2 (Adipo-R2). Studies have shown the presence of Adipo-R1 and Adipo-R2 expression immunohistochemically in human colorectal cancers (CRCs). However, only a few studies exist which investigated effects of adiponectin receptor expression on CRC characteristics. Objectives: In the present study, we aimed to explore Adipo-R1/-R2 expression in human colorectal cancers and any association with clinicopathological characteristics and survival. Materials and Methods: The study enrolled 58 colorectal cancer patients with tumor resection and a control group of 30 subjects with normal colon mucosa. Results: Positivity for Adipo-R1/-R2 expression was significantly more common in the control group in comparison to the patient group (both p<0.001). There was no significant association between Adipo-R1/-R2 expression and clinicopathological characteristics including age, sex tumor location, pTNM stage, Duke's stage, metastasis, histological differentiation, perineural invasion, venous invasion sex, lymphatic invasion, cancer-related mortality, tumor size and recurrence. AdipoR1/-R2 positivity was also not significantly linked to progression-free or overall survival [p values (0.871, 0.758) and (0.274, 0.232), respectively]. Conclusions: Although significantly reduced Adipo-R1/-R2 expression was found in colorectal cancer patients, it had no influence on survival.
Cytokeratin 7/20 expression patterns and association with prognostic variables in gastric adenocarcinomas
(Carbone Editore, 2014) Uğraş, Nesrin; Öz Atalay, Fatma; Ocakoğlu, Gökhan; Yerci, Ömer; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Patoloji Anabilim Dalı.; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Biyoistatistik Anabilim Dalı.; AAH-5180-2021; AAH-2716-2021; HLG-6346-2023; 55386535600; 15623010600; 15832295800; 6603810549
Aim: The histologic features, potential behavior; genetic pathways, epidemiological characteristics and response to treatment of gastric carcinomas, is showing heterogeneity. Cytokeratin (CK), an intermediate sized filament detected primarily in epithelial Cells. Most commonly used CKs in immunohistochemical studies are CK7, CK20 and these molecules are used as a markers to help identify the site of origin of metastatic carcinomas. The aim of this study to evaluate the expression pattern of CK7 and CK20 molecules in primary adenocarcinoma of the stomach and their relation between clinicopathologic prognostic factors. Material and method: Gastric adenocarcinoma specimens were obtained from 103 patients who underwent total I subtotal gastrectomy with extended lymphadenectomy between December 2011-December 2013. Results: The 103 gastric adenocarcinomas included 80 (77.60%) cases with CK7 expression and 56 (54.30%) cases with CK20 expression, and were classified into 4 (3.80%) cases with CK7-/CK20 - pattern, 43 (41.70%) cases with CK7+/CK20 - pattern, 19 (18.40%) cases with CK7-/CK20+ pattern and 37 (36.10%) cases with CK7+/CK20+ pattern. CK expression patterns was not associated with additional variables which were age, gender, tumor location, size, depht of invasion, lymphatic and perineural invasion, lymph. node and distal organ involvement, existence of H. pylori and intestinal metaplasia, his type according to Lauren classification system and p53 expression. Conclusion: The CK expression patterns cannot helpful in determining prognostic factors for gastric adenocarcinoma.
Effect of chitosan coating on surgical sutures to strengthen the colonic anastomosis
(Türk Travma ve Acil Cerrahi Derneği, 2018-09) Chung, Soon Soup; Altınel, Yüksel; Okay, Güven; Uğraş, Nesrin; Işık, Ahmet Fatih; Öztürk, Ersin; Özgüç, Halil; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Genel Cerrahi Anabilim Dalı.; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Biyoistatistik Anabilim Dalı.; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Patoloji Kliniği.; Uludağ Üniversitesi/Tekstil Mühendisliği Fakültesi/Tekstil Bölümü.; AAL-9231-2020; AAH-2716-2021; 26657125600; 57204588493; 55386535600; 56217319800; 35070171400; 6603867989
BACKGROUND: We evaluated the feasibility of chitosan-coated sutures for intestinal anastomosis strength through wound-healing effect. METHODS: Vicryl and PDS sutures were coated with 2% chitosan. While laparotomy was applied to the first group, chitosan was applied in the peritoneal cavity in the second group. Then the following materials were applied to colon anastomosis, in order: Vicryl, PDS, chitosan-coated Vicryl, and chitosan-coated PDS sutures. On the 7th and 14th days, eight rats from each group were euthanized. RESULTS: The adhesion scores of chitosan and control groups were lower than the suture groups. The vascularization of Vicryl-chitosan was lower than PDS-chitosan on the 14th day (p=0.038). Fibroblast cells and vascularization of anastomosis with chitosan-coated Vicryl were lower than Vicryl and chitosan-coated PDS on the 14th day (p<0.05). The tensile strength of Vicryl-chitosan increased more than Vicryl in vitro (p<0.05) on the 14th and 7th days, but there was no difference in vivo. The tensile strength of PDS-chitosan decreased more than PDS on the 7th day in vivo (p<0.05). CONCLUSION: The chitosan-coating effect on the adhesion and reinforcement of anastomosis in some parts of Vicryl in vitro and PDS in vivo was slightly improved.
Enhancer of zeste homologue 2 (EZH2) expression in synovial sarcomas as a promising indicator of prognosis
(Assoc Basic Medical Sci Federation Bosnia & Herzegovina Sarajevo, 2017) Özgün, Gonca; Yalçınkaya, Ulviye; Uğraş, Nesrin; Ocakoğlu, Gökhan; Deligönül, Adem; Çetintaş, Sbel Kahraman; Bilgen, Muhammed Sadık; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Cerrahi Patoloji Anabilim Dalı.; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Biyoistatistik Anabilim Dalı.; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Tıbbi Onkoloji Anabilim Dalı.; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Radyasyon Onkolojisi Anabilim Dalı.; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Ortopedi Anabilim Dalı.; AAH-5180-2021; AAA-7047-2020; AAH-8924-2021; AAH-2716-2021; 6508300295; 55386535600; 15832295800; 37088030300; 6505881756; 35723877700
Synovial sarcoma (SS) is a type of soft-tissue sarcoma, often linked to poor survival. Although overexpression of enhancer of zeste homologue 2 (EZH2) has been associated with poor prognosis in different tumors, a few studies investigated this link in SS. Here, we analyzed the relationship between EZH2 expression and prognostic factors in SS. We included 29 patients with SS. Immunostaining of EZH2 was performed with (D2C9) XP (TM) Rabbit mAb antibody, and the results were classified as low EZH2 expression (negative or weak expression) and high EZH2 expression category (moderate or strong expression). Analysis of survival in relation to prognostic factors was performed with Kaplan-Meier survival curves and Cox proportional hazard regression analysis. Our sample included 19/29 female and 10/29 male patients, with age range 16-63 years. The tumor diameter ranged from 2 to 15 cm. Necrosis was observed in 15/29 cases. Sixteen cases had > 10 mitoses per 50 high-power fields (HPFs). Out of 29 cases, 14 showed low and 15 had high EZH(2) expression. Statistically significant results were obtained for the association between the presence of metastasis and necrosis (p = 0.042), high EZH2 expression and distant metastasis (p = 0.018), high EZH2 expression and necrosis (p = 0.016), and high EZH2 expression and the tumor size > 5 cm versus tumor size <= 5 cm (p = 0.014). Patients with all of the following: the tumor size <= 5 cm, low EZH2 expression, and without necrosis and distant metastasis had significantly longer survival time. Our results are consistent with previous studies, suggesting that EZH(2) overexpression is an indicator of poor prognosis in SS.
Gastrointestinal yerleşimli lipomalar: 19 olgunun retrospektif analizi
(Bursa Uludağ Üniversitesi, 2021-08-26) Özşen, Mine; Yerci, Ömer; Uğraş, Nesrin; Işık, Özgen; Yılmazlar, Tuncay; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Tıbbi Patoloji Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Genel Cerrahi Anabilim Dalı.; 0000-0002-5771-7649; 0000-0001-7118-5258; 0000-0003-0127-548X; 0000-0002-9541-5035; 0000-0003-1924-0795
Bu tanımlayıcı çalışmada gastrointestinal sistem yerleşimli lipoma tanısı alan olguların sunulması ve bu tümörlerin klinikopatolojik özelliklerinin literatür bilgileri eşliğinde değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Çalışmamızda Tıbbi Patoloji Anabilim Dalı arşivi taranarak gastrointestinal sistem yerleşimli lipoma tanısı alan 19 olgu retrospektif olarak incelendi. Olguların 11'i kadın (%57,9), 8'i erkekti (%42,1). Ortalama yaş değeri 62,3 yaş olarak saptandı (yaş dağılımı 36-78). 19 olgunun 14'ü kolon, 3'ü ince barsak, 1'i mide ve 1'i rektum yerleşimliydi. Angiolipoma tanısı alan inen kolon yerleşimli tek olgu dışında kalan tüm olgular klasik lipoma morfolojsindeydi. Genellikle insidental olarak saptanan lipomalar, obtrüksiyon, intusepsiyon ve kanama gibi ciddi gastrointestinal semptomlara yol açabilen, adenokarsinomalara eşlik edebilen ve malignitelerle ayırıcı tanısı yapılması gereken tümörlerdir. Tüm olgular operasyon öncesinde uygun radyolojik ve endoskopik yöntemlerle incelenmeli ve her olgu için en uygun tedavi seçeneği değerlendirilmelidir.
Immunohistochemical expression of CDX2, CK7, HER2 and HER4 in periampullary adenocarcinoma: Implications for clinicopathology and patient outcomes
(Univ Catholique Louvaın, 2017) Uğraş, Nesrin; Yerci, Ömer; Özgün, Gonca; Deligönül, Adem; Dündar, Halit Ziya; Sarkut, Pınar; Uludağ, Özkan Kanat; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Cerrahi Patoloji Anabilim Dalı.; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Tıbbi Onkoloji Anabilim Dalı.; 0000-0002-7346-7440; AAH-2716-2021; 55386535600; 6603810549; 35520074800; 37088030300; 55453773300; 55806454400; 57193505535
Background : Periampullary carcinomas originate from the pancreatic head, the ampulla, the distal bile duct, or the duodenum. The expression of CK7 and CDX2 has been used in the classification of periampullary carcinomas. There is prognostic value of human epidermal growth factor receptor (HER) 2 and HER 4, which have been linked to poor prognosis in several types of tumors, such as breast and gastric carcinomas. We aimed to evaluate the expression and prognostic value of CDX2, CK7, HER 2, and HER 4 in periampullary adenocarcinoma. Patients and Methods : We retrospectively selected 98 patients who had undergone pancreatoduodenectomy for periampullary adenocarcinoma at our pathology department. The tumor location, pathological subtype, involvement of vessels and lymph nodes, perineural invasion, clinical follow-up, and tumorstage were noted. Immunohistochemistry was performed for CK7, CDX2, HER2, and HER4. Results : CDX2 staining was predictive of perineural invasion. Additionally, there was a significant association between the overexpression of HER2 and HER4 and the presence of perineural invasion. HER4 was significantly positive in patients with the pancreatobiliary subtype compared with patients with the intestinal subtype. Patients with the pancreatobiliary subtype, lymph node involvement, and advanced pT and UICC stages had significantly lower median survival. Conclusion : Our findings suggest that only pancreatobiliary subtype, lymph node involvement and advanced pT and UICC stages were independent predictors of short survival, but the ampulla tumor location predicted a significantly better survival time. The immunohistochemical expression of CDX2, CK7, HER4, and HER2, vessel involvement, and perineural invasion were not associated with the survival of patients with periampullary adenocarcinoma.
Immunohistochemical expression of human epidermal growth factor receptor (HER)-4 and prognosis in patients with metastatic breast cancer
(Imprimatur Publications, 2016) Deligönül, Adem; Evrensel, Türkkan; Avcı, Nilüfer; Uğraş, Nesrin; Türe, Mehmet; Çubukçu, Erdem; Hartavi, Mustafa; Ölmez, Ömer Fatih; Kurt, Ender; Tolunay, Şahsine; Kanat, Özkan; Manavoğlu, Osman; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Tıbbi Onkoloji Anabilim Dalı.; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Patoloji Anabilim Dalı.; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/İç Hastalıkları Anabilim Dalı.; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Tıbbi Genetik Anabilim Dalı.; 0000-0002-9732-5340; 0000-0002-5771-7649; ESM-4544-2022; AAJ-1027-2021; CCT-7946-2022; AAH-2716-2021; ECY-8582-2022; ETP-1691-2022; CUI-5353-2022; DJG-4827-2022; DAS-3088-2022; AAI-1612-2021; CYM-0930-2022; FLP-9613-2022; 37088030300; 6603942124; 55390409800; 55386535600; 6602186133; 53986153800; 55370753300; 26435400000; 7006207332; 6602604390; 55881548500; 6602587152
Purpose: The clinical value of HER4 - a cell surface receptor that belongs to the human epidermal growth factor receptor family - for predicting survival outcomes in patients with breast cancer remains controversial. Herein, we sought to investigate the prognostic significance of HER4 immunohistochemical expression with respect to progression-free survival (PFS) and overall survival (OS) in Turkish patients with metastatic breast cancer (MBC).Methods: MBC patients (N=45; mean age=50.5 +/- 12.7 years) were consecutively enrolled between 2000 and 2006 in the Department of Oncology at the Uludag University Medical Center, Bursa, Turkey. Immunohistochemistry was performed on formalin-fixed, paraffin-embedded sections. The predictive value of HER4 expression was investigated by multivariate analysis after allowance for potential confounders.Results: The mean PFS in the study participants was 11.35 months (range:1-50), whereas the median OS was 22.18 months (range:1-76). The mean PFS in patients with a HER4 immunohistochemical score of 0, 1+, 2+, and 3+ was 11.0 +/- 4.8, 11.3 +/- 7.7, 11.7 +/- 8.1, and 10.4 +/- 7.4 months, respectively (p=0.99). The mean OS in patients with a HER4 score of 0, 1+, 2+, and 3+ was 13.3 +/- 6.8, 25.6 +/- 10.8, 22.9 +/- 10.7, and 13.5 +/- 9.9, months, respectively (p=0.44). The results of multivariate Cox regression analysis indicated that the presence of visceral metastases was the only independent prognostic factor for both OS (HR=3.01, 95% CI=1.56-3.99, p <0.01) and PFS (HR=2.91, 95% CI=1.51-3.78, p <0.01).Conclusion: HER4 immunohistochemical expression is not an independent predictor of OS and PFS in Turkish MBC patients.
Impact of 3'UTR variation patterns of the KRAS gene on the aggressiveness of pancreatobiliary tumors with the KRAS G13D mutation in a Turkish population
(Elsevier, 2016-05-20) Egeli, Ünal; Ak, Seçil; Çeçener, Gülşah; Tunca, Berrin; Tezcan, Gülçin; Sevinç, Elif Demirdoğen; Kaya, Ekrem; Dündar, Halit Ziya; Sarkut, Pınar; Özen, Yılmaz; Balçin, Özkan; Evrensel, Türkkan; Yerci, Ömer; Uğraş, Nesrin; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı.; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Genel Cerrahi Anabilim Dalı.; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Tıbbi Onkoloji Anabilim Dalı.; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültes/ Patoloji Anabilim Dalı.; 0000-0002-5956-8755; 0000-0002-9732-5340; 0000-0002-3760-9755; 0000-0002-1619-6680; 0000-0002-3820-424X; 0000-0002-9562-4195; 0000-0001-7904-883X; AAH-3843-2020; AAJ-1027-2021; AAH-2716-2021; F-8554-2017; ADM-8457-2022; ABI-6078-2020; AAP-9988-2020; AAG-7319-2021; AAH-1420-2021; IOO-2699-2023; EWI-3634-2022; HKB-5363-2023; FOQ-1792-2022; AHB-4845-2022; EGD-8703-2022; 55665145000; 55253485700; 6508156530; 6602965754; 25650627600; 56508326500; 7004568109; 55453773300; 55806454400; 6508243334; 57189756976; 6603942124; 6603810549; 55386535600
Objective: Several studies have demonstrated the importance of mutations in codons 12, 13 and 61 and variations in the 3' untranslated region (3'UTR) of the ICRAS gene, frequently observed genetic events in the progression of pancreatobiliary tumors (PBT). However, limited data exist on the clinical effect of these alterations. The aim of the current study was to clarify the frequency of relevant alterations of the 3'UTR regions of the KRAS gene and the effect of KRAS 3'UTR polymorphisms on the prognosis of patients with codon 12, 13 and 61 mutations in a Turkish population with PBT.Methods: Codons 12, 13, and 61 and 3'UTRs of the KRAS gene were screened by single-strand conformation polymorphism (SSCP) analysis and DNA sequencing in 43 patients and 10 controls. Chi-squared and independent sample T tests were used to evaluate the results of the mutation analysis and clinical features of the patients.Results: We defined the c.38G > A (rs112445441, p.G13D) (39.54%) mutation and two 3'UTR variations, c.*4066delA (rs560890523) (23.26%) and c.*406524066delAA (rs57698689) (6.98%), in the ICRAS gene of Turkish patients. There was a statistically significant relationship between the c.*4066delA (rs560890523) and c.*406524066delAA (rs57698689) variations and invasion and lymph node metastasis status of the patients (p < 0.001). Compared to patients with c.38G > A (rs112445441, p.G13D), patients with c.*4066delA (rs560890523) and c.38G > A (rs112445441, p.G13D) presented more aggressive tumors with highly invasive features. The present study contributes findings regarding the clinical effects of KRAS alterations in PBT. Based on our study, further investigations are required.
Incidentally discovered extensive squamous metaplasia within borderline phyllodes tumor: Presentation of a rare tumor
(Federation Turkish Pathology Soc, 2016-01-01) ÖZ ATALAY, FATMA; UĞRAŞ, NESRİN; Uğraş, Nesrin; Tolunay, Sahsine; TOLUNAY, ŞAHSİNE; Gökgöz, Sehsuvar; GÖKGÖZ, MUSTAFA ŞEHSUVAR; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/PatolojicAnabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Genel Cerrahi Anabilim Dalı.; 0000-0002-7188-6115; AAH-2716-2021; AAI-1612-2021
Phyllodes tumors are uncommon biphasic fibroepithelial neoplasms of breast, comprising less than 1% of all breast neoplasms. We therefore aimed to present the case with its microscopic findings. In this article, we report a 59-year-old female admitted to the general surgery department with a rapidly, enlarging, palpable mass in right breast. After histopathological examination, it was diagnosed as borderline phyllodes tumor with extensive squamous metaplasia. Metaplastic changes are infrequent in the stromal and epithelial component of these tumors. Extensive squamous metaplasia within phyllodes tumor is rare and may occur in benign, borderline and malign subtypes.
İntestinal endometriozis tanılı olguların klinikopatolojik bulgularının değerlendirilmesi
(Bursa Uludağ Üniversitesi, 2023-08-31) Dölek, Rabia; Uğraş, Nesrin; Işık, Özgen; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Tıbbi Patoloji Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Genel Cerrahi Anabilim Dal.; 0000-0002-1751-7693; 0000-0003-0127-548X; 0000-0002-9541-5035
Ekstrapelvik endometriozis, endometrial glandüler ve/veya stromal komponentin ekstrauterin lokalizasyonlarda bulunması olarak tanımlanmakta olup en sık gastrointestinal sistemde görülmektedir. Biyopsi örneğinde endometrial gland ve stroma varlığında endometriozis yönünde tanı vermek zor olmasa da, endoskopik biyopsi materyalleri genellikle endometriozis tanısı için yeterli doku içermemektedir. Çalışmamızda intestinal endometriozis olgularımızda, intestinal epitelde ve endometriozis odağında gözlenen histomorfolojik bulgular belirlenmiş ve endometriozis odağının bulunduğu lokalizasyon ile ilişkisi araştırılmıştır. Endometriotik odağın lokalize olduğu intestinal tabaka ile intestinal epitelde görülen mikroskopik değişikliklerin birbiri ile ilişkili olduğu saptanmış olup, bu mikroskopik değişikliklerin inflamatuar bağırsak hastalığı, iskemik kolit, karsinoma gibi antitelerin taklitçisi olabileceği dikkat çekmiştir.
Ksantogranülomatöz piyelonefritis: 11 olguluk inceleme
(Uludağ Üniversitesi, 2014-02-06) Uğraş, Nesrin; Vuruşkan, Berna Aytaç; Vuruşkan, Hakan; Moray, Melike Nalbant; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Patoloji Anabilim Dalı.; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Üroloji Anabilim Dalı.
Ksantogranülomatöz piyelonefritis, nedeni bilinmeyen nadir görülen bir hastalıktır. Yaygın olmayan bu renal parankimin kronik destrüktif lezyonu, uzun süreli üriner sistem obstrüksiyonu ve enfeksiyonu ile ilişkilidir. Bu retrospektif çalışmada, hastanemizde 2007-2012 yılları arasında Ksantogranülomatöz piyelonefritis tanısı almış 11 vaka tekrar gözden geçirildi. 11 ksantogranülomatöz piyelonefritis hastasının 7’si (% 63. 6) kadın, 4’ü (% 36. 4) erkekti. Ortalama yaş 59’dur. Ağrı ve ateş en sık ortaya çıkan semptomdu. Hastaların tamamında hastalık tek taraflı olup hepsine total nefrektomi uygulanmıştı. Operasyon öncesi ksantogranülomatöz piyelonefritis tanısı koymak oldukça güçtür ve nefrektomi özellikle diffüz vakalarda tedavi seçeneğidir.
Microrna dysregulation as a prognostic biomarker in wild-type RAS/RAF/PTEN/PI3 metastatic colon cancer treated with anti-EGFR therapeutics
(Oxford Univ Press, 2018-03-01) Aksoy, Savaş; Kanat, Özkan; Tunca, Berrin; Ertaş, Hülya; Uğraş, Nesrin; Öztürk, Erman; Yılmazlar, Tuncay; Çeçener, Gülşah; Egeli, Ünal; Yerci, Ömer; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Biyoloji Bölümü; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Patoloji Bölümü; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Onkoloji Bölümü; 0000-0002-1619-6680; 0000-0002-5872-8825; 0000-0002-1559-8047; 0000-0002-3820-424X; 0000-0001-7904-883X; AAH-3847-2021; AAH-2716-2021; ABI-6078-2020; AAH-1420-2021; CAV-8845-2022; CYM-0930-2022; GEG-1913-2022; DJS-4895-2022; CKK-3621-2022; AAP-9988-2020
Mide adenokarsinomunda tümör tomurcuklanmasının prognostik parametreler ile ilişkisi
(Bursa Uludağ Üniversitesi, 2022) Yokuş, Gurbet; Uğraş, Nesrin; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Tıbbi Patoloji Anabilim Dalı.
Mide adenokarsinomu mide epitelinden gelişen malignitelerinin %99’undan fazlasını oluşturmakta olup, dünyadaki önemli sağlık problemlerinden biridir. Günümüzde mide adenokarsinomunda en önemli prognostik parametre tümör invazyonu (T), lenf nodu tutulumu (N) ve uzak organ metastazı (M) varlığına göre değerlendirilen evredir. Ancak aynı evredeki hastalarda heterojen klinik sonuçlar izlenmesi yeni prognostik parametre arayışına neden olmaktadır. Son dönemde tümör tomurcuklanmasının mide kanserindeki prognostik önemi araştırılmaktadır. Bu çalışmada mide adenokarsinomunda tümör tomurcuklanmasının prognostik faktörler ve sağkalım süreleri ile ilişkisini araştırmak amaçlandı. Bursa Uludağ Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Patoloji Anabilim Dalı tarafından 2011-2016 yılları arasında mide adenokarsinomu tanısı alan 167 olguya ait rezeksiyon materyalleri retrospektif olarak incelendi. Hematoksilen&Eozin boyalı kesitlerde tümör tomurcuklanması, intratümöral lenfositik infiltrasyon, histolojik derece, lenfovasküler invazyon ve perinöral invazyon varlığı değerlendirildi. Elde edilen histopatolojik veriler hem birbirleriyle hem de sağkalım süreleri ile karşılaştırıldı. Sonuç olarak tümör tomurcuklanmasının büyük tümör çapı, pT evresi, yüksek histolojik derece, lenfovasküler invazyon, perinöral invazyon ve lenf nodu metastazı varlığıyla ilişkili bulundu. Ayrıca yüksek intratümöral lenfositik infiltrasyon izlenen olgularda mortalite riskinin %52 oranında azaldığı belirlendi. Mevcut bulgular ile mide adenokarsinomunun rutin histopatolojik değerlendirmesinde yer alan histolojik derece, lenfovasküler invazyon ve perinöral invazyon gibi parametrelere ek olarak tümör tomurcuklanması varlığı, derecesi ve intratümöral lenfositik infiltrasyonunun da prognostik parametre olarak kullanılabileceği öngörülmüştür.
Mide biyopsilerinde Sydney sınıflamasına göre histolojik değerlendirme ve helikobakter pilori ile hücre proliferasyon ilişkisinin araştırılması
(Uludağ Üniversitesi, 2009) Uğraş, Nesrin; Yerci, Ömer; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Patoloji Anabilim Dalı.
Çalışmanın amacı; kronik gastrit tanısı almış olguların biyopsi materyallerinin Sydney sistemine göre değerlendirilmesi, parametrelerin yaş gruplarında ve Helikobakter pilori (H. pilori) yoğunluğuna göre karşılaştırılmasıdır. Ayrıca H. pilori enfekte olgularda immunohistokimyasal Ki67 protein ekspresyonunun ve intestinal metaplazili olgularda tip tayinin yapılmasıdır. Çalışmaya alınan 427 olgunun Hematoksilen-Eozin boyalı kesitleri Sydney skorlaması ile değerlendirildi. İntestinal metaplazili 127 olguya Periyodik Asit Schiff / Alcian Blue (PAS/AB) (pH=2,5) ve High Iron Diamine / Alcian Blue (HID/AB) (pH=2,5) kombine boyaları uygulanıldı. İntestinal metaplazilerde Filibe sınıflamasına göre tiplendirme yapıldı. H. pilori pozitif 99, H. pilori negatif 30 olguda ise hücre proliferatif indeksini değerlendirmek için Ki67 uygulandı. Kronik gastrit tanısı alan olguların % 23’ünde H. pilori yoğunluğuyla korele akut inflamasyon izlendi. İntestinal metaplazi ve atrofi antrum lokalizasyonunda daha fazla mevcuttu. H. pilori kolonizasyonu antrumda 31 – 60 yaş aralığında daha fazla saptandı. En sık tip II intestinal metaplazi gözlenirken; 61 yaş üstü grubunda intestinal metaplazi ve atrofi daha yüksek oranda izlendi. Yoğun derecede H. pilori bulunan olgularda, bakteri bulunmayan olgulara göre Ki67 proliferatif indeksi anlamlı olarak yüksek izlendi. Sonuçta; bölgemizde H. pylori oranı gelişmiş ülkelere göre hafif derecede yüksek, H. pilori kolonizasyonu antrumda daha sık iken, 31 yaş altı grubunda pangastrit varlığı, artan yaşla birlikte atrofi ve intestinal metaplazi oranın H. pilori varlığından bağımsız arttığı, H. pilori infeksiyonunun gastrik epitelyal proliferasyonu antrum ve korpusta arttırdığı saptandı. Patolog gastrit tanılı olguların raporlarında H. pilori’nin varlığı, kronik inflamasyon, nötrofil polimorf aktivitesi, glandular atrofi ve intestinal metaplaziyi belirtmelidir. Kanserlerdeki temel patolojinin kontrolsüz proliferasyon olduğu dikkate alınırsa, çalışmamızda H. pilori’ye bağlı karsinogenezde artmış proliferasyonun önemli rolü bulunduğu düşünülen savlarla uygunluk saptandı.
MikroRNA-106a’nın yüksek ekspresyonu kolorektal kanserlerde mikrosatellit instablite durumu ile ilişkilidir
(Bursa Uludağ Üniversitesi, 2021-07-09) Uğraş, Nesrin; Kanat, Özkan; Aksoy, Seçil Ak; Tunca, Berrin; Yılmazlar, Tuncay; Öztürk, Ersin; Aksoy, Fuat; Işık, Özgen; Yerci, Ömer; Mutlu, Melis; Tekin, Çağla; Bursa Uludağ Üniversitesi/İnegöl Meslek Yüksekokulu/İlk ve Acil Yardım Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Genel Cerrahi Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Tıbbi Patoloji Anabilim Dal.; 0000-0002-3760-9755; 0000-0002-1619-6680; 0000-0003-1924-0795; 0000-0001-8593-5101; 0000-0001-5808-9384; 0000-0002-9541-5035; 0000-0001-7118-5258; 0000-0002-6633-3428; 0000-0002-2568-3667
Mikrosatellit instabilite (MSI), DNA tamir genlerindeki hatalardan kaynaklanan ve kolorektal kanserin (KRK) oluşmasına neden olan genetik bir durumdur. Sporadik KRK’larda MSI görülme sıklığı, prognoza olan etkisi literatürde çelişkilidir. Bununla birlikte MSI’ya sahip KRK’larda standart kemoterapi yetersiz kaldığı için yeni tedavi seçeneklerine ihtiyaç duyulmaktadır. micoRNA’lar (miRNA) kanserleşme sürecinde görev alan ve tanıda, prognozda ve tedavide belirteç olarak kullanılan küçük RNA molekülleridir. Mevcut çalışmada, Türk popülasyonuna ait sporadik gelişen KRK’larda MSI’nın görülme sıklığının tanımlanması ve bu tümörlerde miRNA’ların ekspresyon farklılıklarının belirlenmesi amaçlanmıştır. Çalışmada, sporadik KRK tanısı almış 63 hasta değerlendirildi. Hastalara ait arşiv tümör ve normal dokularından DNA ve RNA izolasyonları yapıldı. DNA örneklerinden fragment analizine dayalı MSI testi gerçekleştirildi. qRT-PCR kullanılarak 38 farklı miRNA’nın ekspresyon profili incelendi. 63 hastada MSI görülme oranı %23.8 olarak belirlendi. MSI ve mikrosatellit stabil (MSS) tümörler karşılaştırıldığında, MSI tümörlerde, miR-124 ve miR-106a’nın yüksek ve miR-145’in ise düşük ekspresyon gösterdiği belirlendi (p<0.05). Bununla birlikte miR-106a’nın yüksek ekspresyonunun cerrahi sonrası nüks gelişimi ile ilişkili olduğu saptandı (p=0.002). Elde edilen bulgular ışığında miR-106a’nın özellikle MSI genotipine sahip KRK tümörlerde hedeflenmesi ile KRK hastalarında yeni tedavi protokollerinin oluşturularak nüks oluşumunun engellenebileceğini öngörülmüştür.
MiR-216b targets FGFR1 and confers sensitivity to radiotherapy in pancreatic ductal adenocarcinoma patients without EGFR or KRAS mutation
(Lippincott Williams & Wilkins, 2016-02-10) Egeli, Ünal; Tezcan, Gülçin; Çeçener, Gülşah; Tunca, Berrin; Sevinç, Elif Demirdöğen; Kaya, Ekrem; Ak, Seçil; Dündar, Halit Ziya; Sarkut, Pınar; Uğraş, Nesrin; Yerci, Ömer; Özen, Yılmaz; Evrensel, Türkkan; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı.; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Genel Cerrahi Anabilim Dalı.; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Patoloji Anabilim Dalı.; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Tıbbi Onkoloji Anabilim Dalı.; 0000-0001-7904-883X; 0000-0002-1619-6680; 0000-0002-9732-5340; 0000-0002-3820-424X; 0000-0002-9562-4195; 0000-0002-5956-8755; AAH-1420-2021; ABI-6078-2020; F-8554-2017; AAJ-1027-2021; AAP-9988-2020; AAG-7319-2021; AAH-2716-2021; AAH-3843-2020; 55665145000; 25650627600; 6508156530; 6602965754; 56508326500; 7004568109; 55253485700; 55453773300; 55806454400; 55386535600; 6603810549; 6508243334; 6603942124
Objectives: The success of gemcitabine plus radiotherapy is dependent on the mutation status of pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) tumors in the EGFR and KRAS genes; however, radiotherapy resistance may also be modulated epigenetically by microRNA (miRNA) regulation. In this study, we examined the potential effect of miRNAs on the resistance to radiotherapy in cases without EGFR or KRAS mutation. Methods: The association of EGFR and KRAS mutation status and different expression patterns of 6 selected miRNAs related to the EGFR/KRAS signaling pathway were evaluated in the tumors of 42 patients with PDAC. Results: Reduced miR-216b and miR-217 expression was associated with aggressive tumor characteristics and shortened disease-free survival. In addition, miR-216b expression was reduced 2.7-fold in the cases that did not benefit from therapy, although they did not demonstrate EGFR or KRAS expression (P = 0.0316). A negative correlation between FGFR1 and miR-216b expression (r = -0.355) was found in the tumors of these cases. Conclusions: Further studies and validations are required; in the tumors of patients with PDAC without activating mutations and induced expression of EGFR/KRAS genes, down-regulated miR-216b expression may be associated with a poor response to radiotherapy via deregulation of another signaling pathway related to FGFR1 signaling.
Multifocal early gastric adenocarcinomas with gastric lipomatosis: An unusual coexistence
(Wolters Kluwer Medknow Publications, 2014-10) Uğraş, Nesrin; Kabul, Selva; Yerci, Ömer; Öztürk, Ersin; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Patoloji Anabilim Dalı.; AAH-2716-2021; 55386535600; 56113027300; 6603810549
Multiple warty Dyskeratomas: Case report
(Iranian Scientific Society Medical Entomology, 2014-08) Kılıçoğlu, Mehtap; Uğraş, Nesrin; Adım, Şaduman Balaban; Bülbül, Emel Başkan; Atasoy, Emin; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Patoloji Anabilim Dalı.; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Dermatoloji Anabilim Dalı.; 0000-0002-0144-3263; AAH-1388-2021; AAH-2716-2021; 55386535600; 15730076300; 6602518817; 36478260200
Warty dyskeratoma is a rare tumor that presents mainly as an isolated papule or nodule on the scalp, face or neck in the adults. Warty dyskeratoma frequently arises as a single lesion with a central keratotic plug on the skin of middle-aged or elderly people. Multiple warty dyskeratomas are very rare cutaneous lesions which are mostly seen on the scalp. We herein report a multiple warty dyskeratoma in a female patient.