2022 Cilt 41 Sayı 2

Permanent URI for this collectionhttps://hdl.handle.net/11452/30978

Browse

Browsing by BUU Author "Ateş, Özer"

Filter results by typing the first few letters
Now showing 1 - 2 of 2
  • Thumbnail Image
    Item
    First isolation and characterization of Bovine Herpesvirus 1.2b (BoHV-1.2b ) strain from respiratory tract of cattle in Turkey
    (Bursa Uludağ Üniversitesi, 2022-07-25) Göktuna, Pelin Tuncer; Aytoğu, Gizem; Yeşilbağ, Kadir; Toker, Eda Baldan; Kadiroğlu, Berfin; Ateş, Özer; Bursa Uludağ Üniversitesi/Veteriner Fakültesi/Viroloji Anabilim Dalı.; 0000-0002-3411-081X; 0000-0003-1793-6879; 0000-0003-2468-3945; 0000-0001-5969-6127; 0000-0001-7676-9033
    Analyzing fingerprints by Restriction Length Polymorphism (RFLP) analysis of complete virus genome which is laborious and time-consuming classifies Bovine Herpervirus-1 (BoHV-1) strains into three subtypes, BoHV-1.1, 1.2a, 1.2b. These subtypes can also being referred according to clinical futures, however, no clear relation was shown. Mostly BoHV-1.2b is associated with genital disease conditions. In this study, BoHV-1 isolate was obtained in a nasal swab sample taken from respiratory tract disease. In this study also, phylogenetic analysis which was targeting UL44 (Glycoprotein C) region of the genome, subtyping was carried out by a recently developed multiplex PCR targeting UL39 and US3 region followed by a RFLP analysis using Hind III enzyme. Also, success of isolation was compared in two continuous cell lines. SFT-R cell line found more susceptible for BoHV-1 field sample isolation than MDBK. The obtained isolate (ID:8640) was serologically undistinguishable from Cooper strain while molecular analysis classified as BoHV-1.2b. Current study reports the first isolation of BoHV-1.2b in Turkey as well as infrequent BoHV-1.2b isolation from clinical case of respiratory illness. Results also highlights the efficiency of PCR based RFLP analysis for easy and quick subtyping but demonstrates the requirement of more investigation to reveal differences based on genetic diversity of BoHV-1 field isolates.
  • Thumbnail Image
    Item
    Neonatal buzağı ishal olgularında enterik virusların (BRV, BCoV, BVDV, BToV) çoklu enfeksiyonu
    (Bursa Uludağ Üniversitesi, 2022-12-02) Ateş, Özer; Yeşilbağ, Kadir; Bursa Uludağ Üniversitesi/Veteriner Fakültesi/Viroloji Anabilim Dalı.; 0000-0001-7676-9033; 0000-0003-1793-6879
    Neonatal dönemde en önemli mortalite sebebi olan buzağı ishalleri birçok faktöre bağlı olarak gelişmekte ve büyük ekonomik kayıplara sebep olmaktadır. Türkiye’ de bugüne kadar yapılan epidemiyolojik çalışmalarda, viral etkenlerin yeni doğan buzağılarda önemli oranda neonatal ishal olgularına neden olduğu gösterilmiştir. Bu çalışmada şiddetli ishal ve neonatal ölümlerin görüldüğü buzağılarda çoklu viral enfeksiyonların rolü araştırıldı. Çalışma kapsamında tek bir işletmeden toplanan dışkı örnekleri (n=16) üç farklı hücre hattında (MDBK, HRT-18 ve MA-104) virus izolasyonuna alındı. Tüm örneklere 4 kör pasaj işlemi ve sonrasında IPMA testi uygulandı. Bu süreçte araştırılan enterik virusların (BRV, BCoV, BVDV, BToV) hücre kültüründe izolasyonu yapılamadı. Çalışma kapsamında dışkı örneklerinden PCR ve Ag ELISA testlerinin sonuçlarına göre, ishal semptomu gösteren 16 buzağıdan alınan dışkı örneklerinin 14 (%87,5) adedinde araştırılan enterik virusların en az bir tanesi tespit edildi. Araştırılan olgularda tekli BRV enfeksiyonuna rastlanmazken; 2 (%12,5) hayvanda tek BCoV, 2 (%12,5) hayvanda tek BVDV, 2 (% 12,5) hayvanda tek BToV enfeksiyonu saptandı. Diğer yandan 1 (%6,25) hayvanda BRV ve BVDV, 1 (%6,25) hayvanda BCoV ve BToV, 4 (%25) hayvanda BCoV ve BVDV, 1 (%6,25) hayvanda BVDV ve BToV içeren ikili enfeksiyonlar tespit edildi. 1 (%6,25) hayvanda ise BVDV, BToV ve BCoV olmak üzere enterik virusların oluşturduğu üçlü enfeksiyon saptandı. SDS-PAGE testinde akrilamid jel üzerinde RNA segmentlerinin bant profillerine göre (4/2/3/2) tespit edilen rotavirusun grup A'da yer aldığı gösterildi. Ayrıca çalışmada da PCR testi ile pozitif saptanan rotavirusun, G10P[11] genotipine sahip olduğu, genotip spesifik primerler kullanılarak tespit edildi. Bu araştırmada neonatal buzağı ishallerine sebep olabilen önemli viral etkenler olan BRV, BCoV, BVDV ve BToV’ un aynı işletmede eş zamanlı olarak görülebileceği ve şiddetli hastalık bulguları ve kayıplara neden olabileceği gösterilmiştir.