Person: ŞİMŞEK, ABDURRAHMAN
Loading...
Email Address
Birth Date
Research Projects
Organizational Units
Job Title
Last Name
ŞİMŞEK
First Name
ABDURRAHMAN
Name
12 results
Search Results
Now showing 1 - 10 of 12
Publication The distribution of mature and/or immature myeloid cells and their role in effective anti-viral immune responses in COVID-19 positive patients(Wiley, 2021-08-01) Ermiş, Diğdem Yöyen; Dömbaz, Fatma; Karaçay, Mehmet; Etgü, Onur; Kızmaz, Muhammed Ali; Şimşek, Abdurrahman; Çağan, Eren; Aşan, Ali; Yılmaz, Emel; Kazak, Esra; Pınar, İbrahim Ethem; Bal, Salih Haldun; Arslan, Gözde; Karaca, Mert; Özkocaman, Vildan; Özkalemtaş, Fahir; Akalın, Emin Halis; Budak, Ferah; Oral, Haluk Barbaros; YÖYEN ERMİŞ, DİĞDEM; Dombaz, Fatma; Karaçay, Mehmet; Etgü, Onur; Kızmaz, Muhammed Ali; ŞİMŞEK, ABDURRAHMAN; YILMAZ, EMEL; KAZAK, ESRA; PINAR, İBRAHİM ETHEM; BAL, SALİH HALDUN; Arslan, Gözde; KARACA, MERT; ÖZKOCAMAN, VİLDAN; Özkalemtaş, Fahir; AKALIN, EMİN HALİS; BUDAK, FERAH; ORAL, HALUK BARBAROS; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/İmmünoloji Ana Bilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Sağlık Bilimleri Enstitüsü.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Rasit Durusoy Kan Bankası.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Hemotoloji Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı.; 0000-0001-7288-3250; 0000-0001-5334-7911; 0000-0001-8850-0269; 0000-0002-8856-7356; 0000-0003-1785-3539; 0000-0001-7530-1279; 0000-0001-7625-9148; 0000-0003-0463-6818; KHE-5423-2024; AAU-8952-2020; HKN-2347-2023; JGM-6601-2023; JFS-2013-2023; AAG-7381-2021; K-7285-2012; IZP-9398-2023; F-4657-2014; JWP-2738-2024; GYL-2038-2022; DWR-5356-2022; CXY-4200-2022; CPT-2053-2022; GDP-0005-2022; AAG-8459-2021; FQJ-3657-2022; FQG-8981-2022Publication Macrophage polarization capacity of peripheral blood monocytes and monocytic cell line THP-1 in response to secreted factors from COVID-19 patients(Wiley, 2021-08-01) Etgü, Onur; Karaçay, Mehmet; Dombaz, Fatma; Kızmaz, Muhammed Ali; Şimsek, Abdurrahman; Asan, Ali; Yılmaz, Emel; Kazak, Esra; Pınar, İbrahim Ethem; Bal, Salih Haldün; Özkocaman, Vildan; Özkalemkaş, Fahir; Akalın, Emin Halis; Budak, Ferah; Oral, Haluk Barbaros; Ermiş, Diğdem Yöyen; Etgü, Onur; Karaçay, Mehmet; Dombaz, Fatma; Kızmaz, Muhammed Ali; ŞİMŞEK, ABDURRAHMAN; YILMAZ, EMEL; KAZAK, ESRA; PINAR, İBRAHİM ETHEM; BAL, SALİH HALDUN; ÖZKOCAMAN, VİLDAN; ÖZKALEMKAŞ, FAHİR; AKALIN, EMİN HALİS; BUDAK, FERAH; ORAL, HALUK BARBAROS; YÖYEN ERMİŞ, DİĞDEM; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/İmmünoloji Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/İç Hastalıkları Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Temel Tıp Bilimleri Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Dr Raşit Durusoy Kan Bankası.; 0000-0001-7288-3250; 0000-0001-5334-7911; 0000-0001-8850-0269; 0000-0002-8856-7356; 0000-0003-1785-3539; 0000-0001-9907-1498; 0000-0001-7530-1279; 0000-0001-7625-9148; 0000-0003-0463-6818; JIJ-1849-2023; JHB-7829-2023; DWR-5356-2022; HKN-2347-2023; AAG-7381-2021; GDP-0005-2022; AAG-8459-2021; JGM-6601-2023; KBR-5535-2024; FQG-8981-2022; JIW-1248-2023; AAU-8952-2020; IZP-9398-2023; K-7285-2012; GYL-2038-2022Publication Evaluation of the roles of regulatory B (Breg) cells and B cell exhaustion in COVID-19(Wiley, 2021-08-01) Budak, Ferah; Çağan, Eren; Kızmaz, Muhammed Ali; Şimşek, Abdurrahman; Dombaz, Fatma; Tezcan, Gülçin; Asan, Ali; Bal, S. Haldun; Ermiş, Diğdem Yöyen; Demir, H. İbrahim; Ediger, Dane; Yılmaz, Emel; Oral, Haluk Barbaros; Akalın, E. Halis; BUDAK, FERAH; Kızmaz, Muhammed Ali; ŞİMŞEK, ABDURRAHMAN; Dombaz, Fatma; TEZCAN, GÜLÇİN; BAL, SALİH HALDUN; YÖYEN ERMİŞ, DİĞDEM; Demir, H. İbrahim; EDİGER, DANE; YILMAZ, EMEL; ORAL, HALUK BARBAROS; AKALIN, EMİN HALİS; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/İmmünoloji Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Diş Hekimliği Fakültesi/Temel Bilimler Bölümü.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Göğüs Hastalıkları Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Klinik Mikrobiyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları Anabilim Dalı.; 0000-0001-7625-9148; 0000-0001-5334-7911; 0000-0001-8850-0269; 0000-0001-7288-3250; 0000-0002-5956-8755; 0000-0002-8856-7356; 0000-0001-7585-7971; 0000-0002-2954-4293; 0000-0003-1785-3539; 0000-0003-0463-6818; 0000-0001-7530-1279; AAG-7381-2021; AAH-3843-2020; K-7285-2012; F-4657-2014; IZP-9398-2023; AAU-8952-2020; HKN-2347-2023; DWR-5356-2022; KBR-5535-2024; GYL-2038-2022; GPN-1473-2022; AAE-9142-2019; GDP-0005-2022Publication Association of cytotoxic T lymphocyte subsets with disease severity in Covid-19(Wiley, 2021-08-01) Kızmaz, Muhammed Ali; Çağan, Eren; Şimşek, Abdurrahman; Dombaz, Fatma; Tezcan, Gülçin; Aşan, Ali; Demir, H. İbrahim; Bal, S. Haldun; Ermiş, Diğdem Yöyen; Coşkun, Necmiye Funda; Akalın, E. Halis; Oral, Haluk Barbaros; Budak, Ferah; Kızmaz, Muhammed Ali; ŞİMŞEK, ABDURRAHMAN; Dombaz, Fatma; TEZCAN, GÜLÇİN; Demir, H. İbrahim; BAL, SALİH HALDUN; YÖYEN ERMİŞ, DİĞDEM; COŞKUN, NECMİYE FUNDA; AKALIN, EMİN HALİS; ORAL, HALUK BARBAROS; BUDAK, FERAH; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/İmmünoloji Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Diş Hekimliği Fakültesi/Temel Bilimler Bölümü.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Göğüs Hastalıkları Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Klinik Mikrobiyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları Anabilim Dalı.; 0000-0001-5334-7911; 0000-0001-8850-0269; 0000-0001-7288-3250; 0000-0002-5956-8755; 0000-0002-8856-7356; 0000-0001-7585-7971; 0000-0003-3604-8826; 0000-0001-7530-1279; 0000-0003-0463-6818; 0000-0001-7625-9148; 0000-0003-3604-8826; HKN-2347-2023; IZP-9398-2023; AAH-3843-2020; F-4657-2014; AAG-7381-2021; K-7285-2012; AAU-8952-2020; DWR-5356-2022; GPN-1473-2022; KBR-5535-2024; GYL-2038-2022; AAD-1271-2019Publication The age-dependent role of Th22, Tc22, and Tc17 cells in the severity of pneumonia in COVID-19 immunopathogenesis(Wiley, 2021-08) Şimşek, Abdurrahman; Çağan, Eren; Kızmaz, Muhammed Ali; Dombaz, Fatma; Tezcan, Gülçin; Asan, Ali; Demir, H. İbrahim; Bal, S. Haldun; Ermiş, Diğdem Yoyen; Demirdöğen, Ezgi; Heper, Yasemin; Akalın, E. Halis; Oral, Haluk Barbaros; Budak, Ferah; ŞİMŞEK, ABDURRAHMAN; TEZCAN, GÜLÇİN; BAL, SALİH HALDUN; DEMİRDÖĞEN, EZGİ; BUDAK, FERAH; HEPER, YASEMİN; AKALIN, EMİN HALİS; Kızmaz, Muhammed Ali; Dombaz, Fatma; YÖYEN ERMİŞ, DİĞDEM; ORAL, HALUK BARBAROS; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi; 0000-0001-8850-0269; 0000-0001-5334-7911; 0000-0001-7288-3250; 0000-0002-5956-8755; 0000-0002-7400-9089; 0000-0001-7625-9148; AAG-7381-2021; HKN-2347-2023; DWR-5356-2022; KBR-5535-2024; GYL-2038-2022; AAH-9812-2021; CTY-9474-2022; AAU-8952-2020; IZP-9398-2023; K-7285-2012; AAH-3843-2020Publication Assessment of CD39 expression in regulatory T-cell subsets by disease severity in adult and juvenile COVID-19 cases(Wiley, 2022-01-26) Şimşek, Abdurrahman; Kızmaz, Muhammed A.; Çağan, Eren; Dombaz, Fatma; Tezcan, Gülçin; Asan, Ali; Demir, H. İbrahim; Bal, S. Haldun; Ermiş, Diğdem Y.; Dilektaşlı, Aslı G.; Kazak, Esra; Akalın, E. Halis; Oral, H. Barbaros; Budak, Ferah; ŞİMŞEK, ABDURRAHMAN; Kızmaz, Muhammed A.; Dombaz, Fatma; TEZCAN, GÜLÇİN; Demir, H. İbrahim; BAL, SALİH HALDUN; YÖYEN ERMİŞ, DİĞDEM; GÖREK DİLEKTAŞLI, ASLI; KAZAK, ESRA; AKALIN, EMİN HALİS; Oral, H. Barbaros; ORAL, HALUK BARBAROS; BUDAK, FERAH; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/İmmünoloji Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Sağlık Bilimleri Enstitüsü/İmmünoloji Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Diş Hekimliği Fakültesi/Temel Bilimler Bölümü.; Bursa Uludağ Üniversitesi/tıp Fakültesi/Göğüs Hastalıkları Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Klinik Mikrobiyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları Anabilim Dalı.; 0000-0001-8850-0269; 0000-0001-5334-7911; 0000-0001-7288-3250; 0000-0002-5956-8755; 0000-0001-7585-7971; 0000-0001-5871-8769; 0000-0001-7099-9647; 0000-0001-7530-1279; 0000-0003-0463-6818; 0000-0001-7625-9148; AAH-3843-2020; F-4657-2014; HJY-9001-2023; K-7285-2012; DWR-5356-2022; IZP-9398-2023; AAG-7381-2021; HKN-2347-2023; AAU-8952-2020; AAH-3888-2021; HKN-2347-2023; GPN-1473-2022; DTT-7416-2022COVID-19 is a disease characterized by acute respiratory failure and is a major health problem worldwide. Here, we aimed to investigate the role of CD39 expression in Treg cell subsets in COVID-19 immunopathogenesis and its relationship to disease severity. One hundred and ninety COVID-19 patients (juveniles, adults) and 43 volunteers as healthy controls were enrolled in our study. Flow cytometric analysis was performed using a 10-color monoclonal antibody panel from peripheral blood samples. In adult patients, CD39(+) Tregs increased with disease severity. In contrast, CD39(+) Tregs were decreased in juvenile patients in an age-dependent manner. Overall, our study reveals an interesting profile of CD39-expressing Tregs in adult and juvenile cases of COVID-19. Our results provide a better understanding of the possible role of Tregs in the mechanism of immune response in COVID-19 cases.Publication The age-dependent role of Th22, Tc22, and Tc17 cells in the severity of pneumonia in COVID-19 immunopathogenesis(Mary Ann Liebert, 2022-04-23) Çağan, Eren; Tezcan, Gülçin; Şimşek, Abdurrahman; Kızmaz, Muhammed Ali; Dombaz, Fatma; Asan, Ali; Demir, H. İbrahim; Bal, Haldun; Yoyen Ermiş, Diğdem; Görek Dilektaşlı, Aslı; Kazak, Esra; Akalın, E. Halis; Oral, H. Barbaros; Budak, Ferah; TEZCAN, GÜLÇİN; ŞİMŞEK, ABDURRAHMAN; BAL, SALİH HALDUN; YÖYEN ERMİŞ, DİĞDEM; GÖREK DİLEKTAŞLI, ASLI; KAZAK, ESRA; AKALIN, EMİN HALİS; ORAL, HALUK BARBAROS; BUDAK, FERAH; Cagan, Eren; Kızmaz, Muhammed Ali; Dombaz, Fatma; Demir, H. İbrahim; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/İmmünoloji Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Diş Hekimliği Fakültesi/Temel Bilimler Bölümü.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Sağlık Bilimleri Enstitüsü/İmmünoloji Bilimdalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Göğüs Hastalıkları Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Klinik Mikrobiyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları Anabilim Dalı.; 0000-0002-5956-8755; 0000-0001-8850-0269; 0000-0001-5334-7911; 0000-0001-7288-3250; 0000-0002-8856-7356; 0000-0001-7585-7971; 0000-0001-5871-8769; 0000-0001-7099-9647; 0000-0001-7530-1279; 0000-0003-0463-6818; 0000-0001-7625-9148; K-7285-2012; HJY-9001-2023; F-4657-2014; HJI-2036-2023; AAU-8952-2020; HKN-2347-2023; AAG-7381-2021; AAH-3843-2020; AAH-3888-2021; IZP-9398-2023; DWR-5356-2022; GPN-1473-2022; DTT-7416-2022Coronavirus disease 2019 (COVID-19) has clinical manifestations ranging from mild symptoms to respiratory failure, septic shock, and multi-organ failure. Lymphocytes are divided into different subtypes based on their cytokine production pattern. In this study, we investigated the role of cytokine expressions of CD4(+) T (T helper [Th]1, Th2, Th17, Th22) and CD8(+) T cell subtypes (T cytotoxic [Tc]1, Tc2, Tc17, Tc22) in the pathogenesis of COVID-19. Peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) were extracted with Ficoll by density gradient centrifugation from blood samples of 180 COVID-19 patients (children and adults) and 30 healthy controls. PBMCs were stimulated with PMA and Ionomycin and treated with Brefeldin A in the fourth hour, and a 10-colored monoclonal antibody panel was evaluated at the end of the sixth hour using flow cytometry. According to our findings, the numbers of Th22 (CD3(+), CD4(+), and interleukin [IL]-22(+)) and Tc22 (CD3(+), CD8(+), IL-22(+)) cells increased in adult patients regardless of the level of pneumonia (mild, severe, or symptom-free) as compared with healthy controls (p < 0.05). In addition, the number of Tc17 (CD3(+), CD8(+), and IL-17A(+)) cells increased in low pneumonia and severe pneumonia groups compared with the healthy controls (p < 0.05). Both IL-22 and IL-17A production decreased during a follow-up within 6 weeks of discharge. Our findings suggest that the increase in only IL-22 expressed Tc22 cells in the 0-12 age group with a general symptom-free course and higher levels of Th22 and Tc22 in uncomplicated adult cases may indicate the protective effect of IL-22. On the contrary, the association between the severity of pneumonia and the elevation of Tc17 cells in adults may reveal the damaging effect of IL-22 when it is co-expressed with IL-17.Publication New biological markers in the diagnosis and follow-up of brucellosis(Wiley, 2021-08-01) Çagan, Eren; Kızmaz, Muhammed Ali; Şimşek, Abdurrahman; Akalın, Halis; Oral, Haluk Barbaros; Budak, Ferah; Çagan, Eren; Kızmaz, Muhammed Ali; ŞİMŞEK, ABDURRAHMAN; AKALIN, EMİN HALİS; ORAL, HALUK BARBAROS; BUDAK, FERAH; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/İmmünoloji Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Mikrobiyoloji ve Enfeksiyon Anabilim Dalı.; 0000-0001-5334-7911; 0000-0001-8850-0269; 0000-0001-7530-1279; 0000-0003-0463-6818; 0000-0001-7625-9148; HJI-2036-2023; HKN-2347-2023; K-7285-2012; F-4657-2014; IZP-9398-2023; AAG-7381-2021; AAU-8952-2020Publication Peripheral CD39-expressing regulatory T cell subsets play an age-dependent role in the severity of COVID-19(Wiley, 2021-08-01) Çağan, Eren; Şimşek, Abdurrahman; Kızmaz, Muhammed Ali; Dombaz, Fatma; Tezcan, Gülçin; Asan, Ali; Demir, H. İbrahim; Bal, S. Haldun; Ermiş, Diğdem Yöyen; Dilektaşlı, Aslı Görek; Kazak, Esra; Akalın, E. Halis; Oral, Halük Barbaros; Budak, Ferah; ŞİMŞEK, ABDURRAHMAN; Kızmaz, Muhammed Ali; Dombaz, Fatma; TEZCAN, GÜLÇİN; Demir, H. İbrahim; BAL, SALİH HALDUN; YÖYEN ERMİŞ, DİĞDEM; GÖREK DİLEKTAŞLI, ASLI; KAZAK, ESRA; AKALIN, EMİN HALİS; ORAL, HALUK BARBAROS; BUDAK, FERAH; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/İmmünoloji Anabilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Diş Hekimliği Fakültesi/Temel Bilimler Bölümü.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Klinik Mikrobiyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları Anabilim Dalı.; 0000-0001-7625-9148 ; 0000-0002-5956-8755 ; 0000-0001-5334-7911 ; 0000-0001-8850-0269 ; AAG-7381-2021; HKN-2347-2023; DWR-5356-2022; AAH-3843-2020; GPN-1473-2022; KBR-5535-2024; GYL-2038-2022; DTT-7416-2022; AAG-8459-2021; AAU-8952-2020; K-7285-2012; IZP-9398-2023European Federat Immunol SocPublication Phenotypes and functions of low(er)-density neutrophils (LDNs) in early childhood and children(Wiley, 2021-08-01) Dombaz, Fatma; Karaçay, Mehmet; Etgü, Onur; Kızmaz, Muhammed Ali; Şimşek, Abdurrahman; Çağan, Eren; Pınar, İbrahim Ethem; Bal, Salih Haldun; Özkocaman, Vildan; Özkalemkaş, Fahir; Budak, Ferah; Oral, Halük Barbaros; Ermiş, Diğdem Yöyen; Dombaz, Fatma; Karaçay, Mehmet; Etgü, Onur; Kızmaz, Muhammed Ali; ŞİMŞEK, ABDURRAHMAN; PINAR, İBRAHİM ETHEM; BAL, SALİH HALDUN; ÖZKOCAMAN, VİLDAN; ÖZKALEMKAŞ, FAHİR; BUDAK, FERAH; ORAL, HALUK BARBAROS; YÖYEN ERMİŞ, DİĞDEM; Bursa Uludağ Üniversitesi/Sağlık Bilimleri Yüksekokulu.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Dahili Tıp Bilimleri Anabilim Dalı/Hematoloji Bilim Dalı.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Dr. Rasit Durusoy Kan Bankası.; Bursa Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/İmmünoloji Anabilim Dalı.; 0000-0001-7625-9148 ; 0000-0001-9907-1498 ; 0000-0001-8850-0269 ; 0000-0001-5334-7911 ; DWR-5356-2022; JHB-7829-2023; JIJ-1849-2023; HKN-2347-2023; AAG-7381-2021; KBR-5535-2024; FQG-8981-2022; JIW-1248-2023; IZP-9398-2023; K-7285-2012; GYL-2038-2022