TrDizin

Permanent URI for this collectionhttps://hdl.handle.net/11452/21452

Browse

Browsing by Author "0000-0001-5428-3630"

Filter results by typing the first few letters
Now showing 1 - 9 of 9
  • Thumbnail Image
    Item
    Abortion due to Streptococcus equi subspecies zooepidemicus in a Mare
    (TÜBİTAK, 2005) Kocabıyık, Ali Levent; Sönmez, Gürsel; Ülgen, Mihriban; Özakın, Cüneyt; Kocakaya, Esra; Alasonyalılar, Aylin; Uludağ Üniversitesi/Veteriner Fakültesi/Mikrobiyoloji Anabilim Dalı.; Uludağ Üniversitesi/Veteriner Fakültesi/Patoloji Anabilim Dalı.; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Mikrobiyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları Anabilim Dalı.; 0000-0002-6307-5179; 0000-0001-5428-3630; AAP-7233-2020; AAG-8117-2021; AAG-8392-2021; 6506905121; 55167435000; 56259664500; 57200678942; 8529950600; 8529950700
    The organs of an aborted equine fetus were examined histopathologically and microbiologically. Diffuse, mild cellular infiltration of neutrophils, lymphocytes and plasma cells was observed in the lamina propria of the intestine. In addition, bacterial colonies were seen in the intestinal content, wall of intestine and liver. Streptococcus equi subsp. zooepidemicus was isolated in pure culture from all organs. This is the first report of the isolation of S. equi subsp. zooepidemicus from an aborted equine fetus in Turkey.
  • Thumbnail Image
    Item
    Antibiotic release and antibacterial efficacy in cement spacers and cement beads impregnated with different techniques: In vitro study
    (Türk Eklem Hastalıkları Vakfı, 2018) Şahin, Namık; Atıcı, Teoman; Çavun, Sinan; Özakın, Cüneyt; Kaleli, Tufan; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Ortopedi ve Travmatoloji Anabilim Dalı.; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Tıbbi Farmakoloji Anabilim Dalı.; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı.; 0000-0001-5428-3630; A-5095-2018; AAC-9702-2019; AAB-6136-2022; AAG-8392-2021; 7801647288; 6507468595; 57200678942; 6603422875
    Objectives: This study aims to compare the antibiotic release and biological effectiveness of bead type and articulating spacers of different cement types with antibiotics added at alternative phases of cement preparation. Materials and methods: Four gram vancomycin was added into two types of antibiotic-free cement (Simplex®, Biomet®) with similar viscosity and also gentamycin-containing cement (Refobacin®). Prepared specimens were used to create cement beads and articulating hip spacers, making a total of six different groups. Two alternative groups were formed by adding the Vancomycin while the cement was in dough phase. Antibiotic release and biological activity were evaluated with immunoassay techniques and agar-disk diffusion methods. Results: All groups showed initial antibiotics surge in the first week, which was 2 to 4 times more evident in the beads group. Antibiotic release and change in release rate were significantly different between Simplexalternative and Simplex, Biomet, Refobacin-beads, and between Biometspacer and Refobacin-beads groups (p<0.05). Elution of antibiotics was not different between mobile spacers prepared with conventional or alternative methods (p>0.05). Biomet cement showed larger diffusion inhibition zone in agar. There was no difference between biological activity of the bead and mobile designs of the Biomet brand (p>0.05). Inhibition zone analyses of agar and disk diffusion tests revealed significant differences between several groups (p<0.05). Conclusion: Cement beads provide superior antibiotic release regardless of cement type or preparation method. Simplex P® cement has lower anti-bacterial efficiency than Biomet®. Different methods for cement and antibiotics mixing and addition of extra vancomycin into the commercially drug loaded cement do not have any effect on the results.
  • Thumbnail Image
    Item
    Enterococcus faecalis ile enfekte edilen yumurtacı piliçlerde A vitamini'nin amiloid artropati oluşumunu artırıcı etkisi
    (TÜBİTAK, 2004) Sevimli, Alper; Mısırlıoğlu, Deniz; Özakın, Cüneyt; Uludağ Üniversitesi/Veteriner Fakültesi/Patoloji Anabilim Dalı.; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Mikrobiyoloji Anabilim Dalı.; 0000-0001-5428-3630; AAG-8392-2021; 6507915874; 6507455482; 57200678942
    The enhancing effect of vitamin A on the occurrence of amyloid arthropathy in Brown layer chickens is reported. In this study, 36 female and 36 male chickens were used. The chickens were allocated into 3 groups. Group I (Vitamin A group) was fed a diet which contained high levels of Vitamin A (75,000 I.U/kg), whereas group II (positive control) and group III (negative control) were fed a diet containing normal levels of vitamin A. In the fifth week of the experiment Enterococcus faecalis (10(9) cfu/ml) was injected into the left femoro-tibial joint in groups I and II (in order to produce amyloid arthropathy) and 0.9% NaCl (0.25 ml) in group Ill. At the end of the study, the amyloidosis occurrence rates and the severity of amyloid accumulation were compared. The occurrence of amyloid arthropathy in the vitamin A, the positive control and the negative control groups was 19/20 (95%), 18/24 (75%) and 0/24 (0%), respectively, and the differences among the groups were statistically significant (P < 0,01). Severe amyloid accumulation was observed in 8/20 (42.1 %) chickens in the vitamin A group, while no severe accumulation was found in the positive control group (P < 0,05). In conclusion, these data showed that high levels of vitamin A in the diet can enhance the occurrence and the severity of amyloid arthropathy induced with E. faecalis in Brown layer chickens.
  • Thumbnail Image
    Item
    Faecal carriage of Listeria monocytogenes in stray dogs in Bursa province, Turkey
    (TÜBİTAK, 2005) Kocabıyık, A. Levent; Çetin, Cengiz; Özakın, Cüneyt; Uludağ Üniversitesi/Veteriner Fakültesi/Mikrobiyoloji Anabilim Dalı.; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Mikrobiyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları Anabilim Dalı.; 0000-0001-5428-3630; AAG-8392-2021; 6506905121; 7003489234; 57200678942
    The faecal carriage rate of Listeria monocytogenes in stray dogs in Bursa province, Turkey, was determined from 82 faecal samples by bacteriological methods. L. monocytogenes was isolated from only one (1.22%) of the samples examined. The isolate was serotyped as 1/2b. It was concluded that stray dogs could be a reservoir of the organism as well as a source of human listeriosis in Turkey. This is the first report on the isolation of L. monocytogenes from a dog in this country.
  • No Thumbnail Available
    Item
    Helicobacter pylori izolatlarının antibiyotik direnç oranları ve klaritromisine dirençli suşların saptanmasında E-test ve floresan in situ hibridizasyon yöntemlerinin karşılaştırılması
    (Ankara Mikrobiyoloji Derneği, 2009-04) Özbey, Saliha Bakir; Özakın, Cüneyt; Keskin, Murat; UIudaǧ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları Anabilim Dalı.; Uludaǧ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Mikrobiyoloji Anabilim Dalı.; Uludaǧ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Gastroenteroloji Anabilim Dalı.; 0000-0001-5428-3630; 0000-0003-4526-4352; AAG-8392-2021; 24480281800; 57200678942; 23050640000
    Helicobacter pylori which is one of the commonly seen chronic bacterial infections in the world, has been demonstrated to have a relationship with chronic gastritis, peptic ulcer disease and gastric cancer. Current management of H.pylori infection involves the use of a proton pump inhibitor (PPI) and any two of amoxicillin, clarithromycin and metronidazole in combination. Antibiotic resistance which is in an increasing trend in H.pylori since the recent years, is the main cause of treatment failure. This study was conducted to determine the susceptibility of 31 H.pylori strains to several antibiotics by using E-test method (AB Biodisk, Sweden) and also to detect clarithromycin resistance by fluorescent in situ hybridization (FISH; SedFAST (R), Hungary). The strains were isolated from the gastric biopsy specimens of patients who were admitted to Uludag University Hospital, Bursa, Turkey with dyspeptic complaints. Clarithromycin, amoxycillin, metronidazole, tetracycline and ciprofloxacin resistance rates were as 41.9%, 3.2%, 41.9%, 3.2% and 45.2%, respectively. Resistance to single antibiotic was detected in 32.2% of the isolates whereas multiresistance was seen in 45.2%. For the hybridization process one probe specific for 16S rRNA and labeled with a fluorescein dye and the other probe specific for the mutations in 23S rRNA and labeled with Cy3 stain were used. Green signalling denoted presence of H.pylori in the specimen and red signalling was associated with clarithromycin resistance. All of the isolates yielded green signalling and the 13 isolates found to be resistant to clarithromycin by E-test, gave red signalling. No difference was detected between the two methods in terms of clarithromycin resistance determination. This was a preliminary study reporting the H.pylori resistance rates in our region, however, further larger scale studies are required for obtaining countrywide data.
  • Thumbnail Image
    Item
    Keçilerde deneysel oluşturulan septik artritisin farklı dönemlerinde, artroskopik tanı ve sağaltımında artroskopik lavaj ve intraartiküler antibiyotik uygulanmasının karşılaştırılması
    (Kafkas Üniversitesi, 2010) Görgül, Osman Sacit; Salcı, Hakan; Özakın, Cüneyt; Cilo, Burcu Dalyan; Seyrek, Deniz İntaş; Çelimli, Nureddin; Çeçen, Göksen; Uludağ Üniversitesi/Veterinerlik Fakültesi/Klinik Bilimler Bölümü.; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı.; 0000-0001-5428-3630; 0000-0001-8537-0761; AAG-8392-2021; AAK-9543-2020; T-4623-2019; 6507730974; 8680329000; 57200678942; 36620979500; 6506990178; 8680328800; 16041418200
    Bu çalışmanın amacı keçilerde, deneysel oluşturulan septik artritisin (SA) farklı dönemlerinde klinik, radyolojik, ultrasonografik, artroskopik, mikrobiyolojik ve biyokimyasal bulguların değerlendirilmesi ve sağaltımda artroskopik lavaj (AL) sonrası parenteral (PR) ya da intraartiküler (İA) antibiyotik uygulanmasının etkinliğinin karşılaştırılmasıdır. Saanen ırkı, 12 adet keçinin karpal eklemlerine dönüşümlü olarak (önce sol, daha sonra sağ eklemlerine) 4 x 104 hücre/ml “Staphylococcus aureus” solüsyonu 3 ml enjekte edildi. SA gelişimi, dört ana grup altında ve her ana grupta yer alan 3 keçinin, sol ve sağ karpal eklemlerinde ayrı ayrı değerlendirildi. Bu ana gruplarda klinik, radyolojik, ultrasonografik ve artroskopik tanı ile sinovyal sıvının, mikrobiyolojik ve biyokimyasal analizleri yapıldı. Sağaltım tekniği yönünden ana grupları oluşturan üçer keçinin, sol (Gr.A) ve sağ (Gr.B) karpal eklemleri iki alt guruba ayrıldı. Gr.A’da (3 sol karpal eklem) AL sonrası 6 gün boyunca seftriakson sodyum i.m. uygulandı. SA gelişimiyle birlikte sağaltım sürecinin değerlendirilmesi, 3 aylık süreçte; ilk ay içinde birer hafta arayla, diğer aylarda 15’er gün aralarla eklemlerin klinik, radyolojik ve ultrasonografik muayeneleri ile mikrobiyolojik ve biyokimyasal analizler ile gerçekleştirildi. Gr.B’de (n=3 sağ karpal eklem) ise Gr.A’da uygulanan girişimler ve değerlendirmelerin sonuçlanması sonrasında SA oluşturuldu. AL yapılmasını takiben sadece bir kez İA seftriakson sodyum verildi. Alt grupların ilk muayenelerinde SA bulguları saptandı. Artroskopik muayenede purulent sinovyal sıvı, sinovyal membranın hiperemi ve hiperplazisi, fibrin oluşumları, kıkırdak defektleri gibi bulgular saptandı. Mikrobiyolojik olarak sadece GR1 ve GR2’de ilk kontrol günlerinde etken identifiye edildi. Biyokimyasal analizlerde sinovyal sıvının, total protein ve globülin düzeylerinin artmış olduğu saptandı. Sonuç olarak, SA deneysel oluşturulması sonrasında artroskopinin tanıdaki etkinliği, sinovyal sıvı biyokimyası ve mikrobiyolojik analizlerin tanı ve takipte yararlılığı yadsınamaz. Sağaltımda kullanılan AL sonrası PR ve İA olarak antibiyotik uygulanmasının elde edilen bulgular dikkate alındığında birbirine üstünlüğü olmadığı vurgulanabilir.
  • Thumbnail Image
    Item
    Metisiline dirençli Staphylococcus aureus ve vankomisine dirençli enterokok suşlarının in vitro linezolid duyarlılığı
    (Ankara Microbioloji Derneği, 2009-10) Efe, Şirin; Sınırtaş, Melda; Özakın, Cüneyt; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Mikrobiyoloji Anabilim Dalı.; 0000-0001-5428-3630; AAG-8392-2021; 6505818048; 57200678942
    Metisiline dirençli Staphylococcus aureus (MRSA) ve vankomisine dirençli enterokokların (VRE) neden olduğu enfeksiyonlar, dünyada giderek artan sıklıkta ciddi bir sorun olarak karşımıza çıkmaya başlamıştır. MRSA ve VRE suşları da dahil olmak üzere gram-pozitif bakterilere karşı bakteriyostatik etki gösteren linezolid, oksazolidinon grubunun klinik kullanıma giren ilk üyesidir. Bu çalışmada, MRSA ve VRE klinik izolatlarına karşı linezolidin in vitro aktivitesinin araştırılması amaçlanmıştır. Çalışmaya, Uludağ Üniversitesi Tıp Fakültesi, Mikrobiyoloji Laboratuvarına gönderilen klinik örneklerden enfeksiyon etkeni olarak izole edilen 100 MRSA suşu (96 kan, 2 plevra sıvısı, 1 periton sıvısı, 1 eklem sıvısı izolatı) ile kolonizasyon veya enfeksiyon etkeni olarak izole edilen 101 VRE (Enterococcus faecium) (79 rektal sürüntü, 11 kan, 3 kateter, 3 periton sıvısı, 3 idrar, 2 yara örneği izolatı) suşu dahil edilmiştir. İzolatların in vitro linezolid duyarlılıkları E-test yöntemi ile değerlendirilmiş ve tüm izolatların linezolide duyarlı olduğu saptanmıştır. Minimum inhibitör konsantrasyon (MİK) aralığı, MRSA suşlarında 0.25-3 µg/mL, VRE suşlarında ise 0.25-2 µg/mL olarak saptanmıştır. MİK50 ve MİK90 değerleri, MRSA izolatları için sırasıyla 1.5 µg/mL ve 2 µg/mL; VRE izolatları için sırasıyla 0.75 µg/mL ve 1.5 µg/mL olarak tespit edilmiştir. Elde ettiğimiz sonuçlar, yurt içi ve yurt dışı birçok çalışmadan elde edilen veriler ile uyumlu bulunmuş ve linezolidin dirençli gram-pozitif bakterilerin neden olduğu enfeksiyonların tedavisinde yeni bir seçenek olarak klinik kullanımda yerini alacağını vurgulamıştır
  • Thumbnail Image
    Item
    Mikobakterilerin majör antitüberküloz ilaçlara duyarlılıǧının otomatize bactec MGIT 960 sistemi ile araştırılması ve radyometrik bactec 460 TB sistemi ile karşılaştırılması
    (Ankara Mikrobioloji Derneği, 2009-07) Sınırtaş, Melda; Özakın, Cüneyt; Gedikoğlu, Suna; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Mikrobiyoloji Anabilim Dalı.; 0000-0001-5428-3630; AAG-8392-2021; 6505818048; 57200678942; 6603407548
    Bu çalışmada 100 adet Mycobacterium tuberculosis klinik izolatının, tüberküloz tedavisinde kullanılan 4 majör ilacın [streptomisin (STR), izoniazid (INH), rifampin (RIF) ve ethambutol (EMB)] kritik konsantrasyonlarındaki duyarlılık sonuçları tam otomatize BACTEC MGIT 960 (Becton Dickinson, Cockeysville, Md.) sisteminde çalışılmış ve radyometrik BACTEC 460 TB (Becton Dickinson, Sparks, Md.) sisteminde elde edilen sonuçlar ile karşılaştırılmıştır. BACTEC 460 TB ile uyumlu olmayan BACTEC MGIT 960 sonuçları tekrar çalışılmıştır. İlaçların kritik konsantrasyonlarında her iki sistem arasında %2.25 uyumsuzluk saptanmıştır. Uyumsuz sonuçların tekrar çalışılmasından sonra 2 sistem arasındaki uyumsuzluğun %1.25’e indiği; uyumun %98.75’e yükseldiği gözlenmiştir. Çalışmamızda çok büyük hata saptanmazken; büyük hata oranı 1. çalışmada %2.25 (STR 2, INH 4, RIF 2 ve EMB 1), 2. çalışmada ise %1.25 (INH 3, RIF 2) olarak bulunmuştur. BACTEC MGIT 960 sistemi, BACTEC 460 TB ile karşılaştırıldığında; tüm ilaçlarda özgüllüğün %100, duyarlılığın ise 1. çalışmada %95.6-98.9, 2. çalışmada %96.7-100 oranlarında olduğu saptanmıştır. Sonuç olarak, antitüberküloz duyarlılık test sonuçlarında her iki sistem arasında görülen farklılıkların istatistiksel olarak anlamlı olmadığı, BACTEC MGIT 960 sisteminin, BACTEC 460 TB’nin alternatifi olabileceği kanısına varılmıştır.
  • Thumbnail Image
    Item
    Ön çapraz bağ rekonstrüksiyonu sonrası septik artritte greft koruyucu debridman
    (Türk Ortopedi ve Travmatoloji Birliği Derneği, 2011) Demiraǧ, Burak; Ünal, Ömer Kays; Özakın, Cüneyt; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Ortopedi ve Travmatoloji Anabilim Dalı.; Uludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Mikrobiyoloji Anabilim Dalı Anabilim Dalı.; 0000-0001-5428-3630; 0000-0002-9445-1552; AAG-8392-2021; AAD-2414-2020; 56019156900; 56694130300; 57200678942
    Objective: Although septic arthritis following anterior cruciate ligament (ACL) reconstruction is a rare complication, it has a high morbidity deteriorating the clinical outcome. Current treatment options include long-term antibiotic therapy, open or arthroscopic surgical lavage, aspiration, continuous irrigation, graft preservation, and removal of graft and fixation materials with or without reimplantation. The aim of our study was to evaluate the results of long-term antibiotic treatment with arthroscopic debridement without graft and fixation materials removal in the treatment of septic arthritis following ACL reconstructions. Methods: Seven patients (6 male, 1 female; mean age: 29 years; range: 21 to 40 years) who had septic arthritis following ACL reconstruction at Uludag University, Department of Orthopaedics and Traumatology were included in this study. Three of the patients were athletes, 1 was a heavy-duty worker, 3 were light-medium-duty workers and 1 was an amateur sportsman. Long-term antibiotic therapy was used for 6 weeks. Rehabilitation was arranged according to the patients' effusion, pain and general condition. Evaluations were made using clinical results, manual Lachman and pivot shift tests, and Tegner activity, Lysholm, and IKDC scores. Results: Patients had a mean of 6 (range: 0 to 15) degrees of flexion loss and 3 (range: 0 to 5) degrees of extension loss. Manual Lachman test was near normal for all patients. Pivot shift was positive for 3 and negative for 4 patients. Preoperative and postoperative mean Tegner activity scores were 6 (range: 4 to 7) and 5 (range: 4 to 7), respectively. Preoperative and postoperative mean Lysholm scores were 73.2 (range: 67 to 79) and 74.1 (range: 79 to 89), respectively. Preoperative and postoperative mean IKDC scores were 78.0 (range: 70 to 100) and 80.0 (range: 70 to 100), respectively. Mean leg circumference across the quadriceps muscle was 91% (range: 88 to 93) of the contralateral leg. Single-leg longitudinal jumping length was 78% (range: 63 to 100) of the uninvolved leg. Single-leg horizontal jumping was 72% (range: 88 to 93) of the contralateral leg. Conclusion: Long-term antibiotic therapy and arthroscopic drainage without graft or fixation material removal is effective in patients of regular activity level. Although this procedure is equally successful for treating the infection in competitive athletes and heavy workers, it also results in slight performance loss. Further review is necessary to determine which treatment is suitable for which activity level.