Publication:
Candida izolatlarının antifungal duyarlılığının belirlenmesinde klinik laboratuvar standartları enstitüsü (CLSI) ve avrupa antimikrobiyal duyarlılık testleri komitesi (EUCAST) sıvı mikrodilüsyon yöntemlerinin karşılaştırılması

dc.contributor.buuauthorCilo, Burcu Dalyan
dc.contributor.buuauthorTopaç, Tuncay
dc.contributor.buuauthorAğca, Harun
dc.contributor.buuauthorSağlam, Sezcan
dc.contributor.buuauthorEfe, Kadir
dc.contributor.buuauthorEner, Beyza
dc.contributor.departmentUludağ Üniversitesi/Tıp Fakültesi/Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı.tr_TR
dc.contributor.orcid0000-0002-4803-8206tr_TR
dc.contributor.orcid0000-0002-2651-2034tr_TR
dc.contributor.researcheridAAH-4027-2021tr_TR
dc.contributor.researcheridIVV-5845-2023tr_TR
dc.contributor.researcheridAAG-8523-2021tr_TR
dc.contributor.researcheridGQA-6410-2022tr_TR
dc.contributor.scopusid56364338600tr_TR
dc.contributor.scopusid57196258802tr_TR
dc.contributor.scopusid15759379900tr_TR
dc.contributor.scopusid56783920000tr_TR
dc.contributor.scopusid56490687400tr_TR
dc.contributor.scopusid15053025300tr_TR
dc.date.accessioned2023-11-09T06:34:04Z
dc.date.available2023-11-09T06:34:04Z
dc.date.issued2017-11-08
dc.description.abstractCandida türleri yüksek mortalite ve morbiditeyle ilişkili kan dolaşımı enfeksiyonlarına sebep olan ilk 10 etken arasındadır. Birçok yeni antifungal ilacın geliştirilmesine rağmen epidemiyolojik çalışmalar Candida izolatlarındaki antifungal direncin ciddi bir problem haline gelmeye başladığını göstermiştir. Antifungal duyarlılığı ölçmek için iki standart yöntem vardır ve bu çalışmada kandan elde edilen Candida izolatlarının amfoterisin B, flukonazol, itrakonazol, vorikonazol, posakonazol ve anidulofungin duyarlılığını belirlemek için “Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI)” ve “European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST)” sıvı mikrodilüsyon yöntemlerinin karşılaştırılması amaçlanmıştır. Çalışmada 74 Candida albicans, 67 Candida parapsilosis, 30 Candida glabrata ve 18 Candida tropicalis izolatı kullanılmıştır. Anidulofungin hariç, minimum inhibitör konsantrasyon değerleri, CLSI yönteminde 24 ve 48 saat inkübasyondan sonra, EUCAST yönteminde sadece 24 saat inkübasyondan sonra belirlenmiştir. Her iki yöntemle elde edilen MİK değerleri ± 2 dilüsyon sınırları içerisinde ise uyumlu olarak kabul edilmiştir. Her antifungal için yöntemler arasındaki kategori uyumunda klinik sınır değerler ve epidemiyolojik eşik değerlerden yararlanılmıştır. Yöntemler arasındaki uyum (± 2 dilüsyonda) tür, ilaç ve inkübasyon zamanına bağımlı olarak bulunmuştur. Yirmi dört saat inkübasyon sonunda amfoterisin B, itrakonazol, posakonazol ve anidulofunginde iyi (> %90) kategorisinde uyum bulunurken, flukonazol ve vorikonazolde, özellikle nispeten daha yavaş üreyen C.glabrata ve C.parapsilosis izolatlarında daha düşük kategorisinde uyum (< %85) bulunmuştur. Mükemmel kategori uyumu (%100) amfoterisin B/C. parapsilosis, C.glabrata, C.tropicalis ve andilofungin/C.albicans, C.glabrata, C.tropicalis ile görülürken en kötü uyum, posakonazol ve C.albicans (24 saate %71.6; 48 saatte %73) arasında saptanmıştır. Tedavide sık kullanılan ilaçlar olan flukonazol ve anidulafungine her iki yöntemle tespit edilen direnç C.albicans (sırasıyla %1.3; %2.7), C.glabrata (sırasıyla 0%, %3.3) ve C.tropicalis’de (sırasıyla 0%, %5.6), in vitro azalmış duyarlılık C.parapsilosis ve flukonazolde (24 saatte %11.9; 48 saatte %17.9) görülmüştür. Flukonazol ve vorikonazol arasında çapraz direnç üç C.parapsilosis izolatında saptanmış ve bir C.albicans izolatında ise çok ilaca direnç (flukonazol, itrakonazol, posakonazol ve anidulafungin) tespit edilmiştir. Çalışma sonucunda, her iki yöntemin benzer olduğu ve laboratuvarların tercihine göre kullanılabileceği gözlenmiştir. CLSI antifungal duyarlılık sonuçlarının 24 saat inkübasyon sonunda değerlendirilebileceğinin ancak bazen, C.glabrata gibi yavaş üreyen türlerde 48 saat inkübasyon sonucunda değerlendirme yapılması gerektiğinin önemli olduğu saptanmıştır.tr_TR
dc.description.abstractCandida species are among the top 10 pathogens causing bloodstream infections associated with high morbidity, mortality. In spite of the development of new antifungal drugs, epidemiological studies have shown that resistance to antifungal drugs among Candida isolates is becoming a serious problem. The aim of this study was to compare the antifungal broth microdilution methods of the Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) and European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST) for amphotericin B, fluconazole, itraconazole, voriconazole, posaconazole and anidulafungin susceptibility of Candida blood isolates. The study consisted of 74 Candida albicans, 67 Candida parapsilosis, 30 Candida glabrata, and 18 Candida tropicalis isolates. The minimum inhibitory concentrations were determined after 24 and 48 hour of incubation with CLSI method and only 24 hour of incubation with EUCAST method except anidulofungin. The MIC values obtained by both methods were considered to be compatible within ± 2 dilution limits. The categorical agreement between methods for each antifungal agent was assessed using clinical break points and epidemiological cut-off values. The agreement (± 2 dilution) between the methods was found to be species, drug, and incubation time dependent. After 24 hour incubation, good agreement category (> 90%) was detected between amphotericin B, itraconazole, posaconazole and anidulofungin, but was lower category (< 85%) was determined with fluconazole and voriconazole especially for relatively slow growing C.glabrata and C.parapsilosis isolates. Excellent categorical agreement (100%) was observed for amfoterisin B/C.parapsilosis, C.glabrata, C.tropicalis and anidulofungin/C.albicans, C.glabrata, C.tropicalis but least category was determined for posaconazole and C.albicans (71.6% at 24 hour; 73% at 48 hour). In vitro resistance of therapeutically used fluconazole and anidulafungin determined by both methods was rare among C.albicans (1.3%, 2.7% respectively), C.glabrata (0%, 3.3% respectively) and C.tropicalis (0%, 5.6% respectively) isolates but, an increase of non-susceptible isolates were observed among C.parapsilosis (11.9% at 24 hour of incubation; 17.9% at 48 hour of incubation) for fluconazole. There was also a cross resistance between fluconazole and voriconazole for three C.parapsilosis isolates and one multidrug resistant (fluconazole, itraconazole, posaconazole and anidulofungin) C.albicans isolate (fluconazole, itraconazole, posaconazole and anidulofungin). As a result in this study, it was determined thatboth methods were similar and can be used according to preference of laboratories. The CLSI antifungal susceptibility test results can be assessed at the end of 24 hour incubation, but sometimes it is important that the evaluation should be performed as a result of 48 hour incubation in slow growing species such as C.glabrata.en_US
dc.identifier.citationCilo, B. D. vd. (2018). ''Candida izolatlarının antifungal duyarlılığının belirlenmesinde klinik laboratuvar standartları enstitüsü (CLSI) ve avrupa antimikrobiyal duyarlılık testleri komitesi (EUCAST) sıvı mikrodilüsyon yöntemlerinin karşılaştırılması''. Mikrobiyoloji Bulteni, 52(1), 35-48.tr_TR
dc.identifier.endpage48tr_TR
dc.identifier.issn0374-9096
dc.identifier.issue1tr_TR
dc.identifier.pubmed29642828tr_TR
dc.identifier.scopus2-s2.0-85044817561tr_TR
dc.identifier.startpage35tr_TR
dc.identifier.urihttps://doi.org/10.5578/mb.63991
dc.identifier.urihttp://www.mikrobiyolbul.org/linkout.aspx?pmid=29642828
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11452/34811
dc.identifier.volume52tr_TR
dc.identifier.wos000428835600004
dc.indexed.pubmedPubMeden_US
dc.indexed.scopusScopusen_US
dc.indexed.trdizinTrDizintr_TR
dc.indexed.wosSCIEen_US
dc.language.isotrtr_TR
dc.publisherHacettepe Üniversitesi Ankara Mikrobiyoloji Derneğitr_TR
dc.relation.bapKUAP (T)-2014/3tr_TR
dc.relation.journalMikrobiyoloji Bültenien_US
dc.relation.publicationcategoryMakale - Uluslararası Hakemli Dergitr_TR
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.subjectMicrobiologyen_US
dc.subjectCandida türleritr_TR
dc.subjectAntifungal duyarlılıktr_TR
dc.subjectMinimum inhibitör konsantrasyontr_TR
dc.subjectCandida speciesen_US
dc.subjectAntifungal susceptibilityen_US
dc.subjectMinimum inhibitory concentrationen_US
dc.subjectAntifungal drug-resistanceen_US
dc.subjectSpecies distributionen_US
dc.subject4-year surveyen_US
dc.subjectRisk-factorsen_US
dc.subjectEpidemiologyien_US
dc.subjectNfectionsen_US
dc.subjectMechanismsen_US
dc.subjectManagementen_US
dc.subjectFungemiaen_US
dc.subjectGlabrataen_US
dc.subject.emtreeAntifungal agenten_US
dc.subject.emtreeCandidaen_US
dc.subject.emtreeComparative studyen_US
dc.subject.emtreeDrug effecten_US
dc.subject.emtreeMicrobial sensitivity testen_US
dc.subject.emtreeProceduresen_US
dc.subject.emtreeReproducibilityen_US
dc.subject.emtreeStandardsen_US
dc.subject.meshAntifungal agentsen_US
dc.subject.meshCandidaen_US
dc.subject.meshMicrobial sensitivity testsen_US
dc.subject.meshReproducibility of resultsen_US
dc.subject.scopusCandidemia; Invasive Candidiasis; Antifungal Agentsen_US
dc.subject.wosMicrobiologyen_US
dc.titleCandida izolatlarının antifungal duyarlılığının belirlenmesinde klinik laboratuvar standartları enstitüsü (CLSI) ve avrupa antimikrobiyal duyarlılık testleri komitesi (EUCAST) sıvı mikrodilüsyon yöntemlerinin karşılaştırılmasıtr_TR
dc.title.alternativeComparison of clinical laboratory standards institute (CLSI) and european committee on antimicrobial susceptibility testing (EUCAST) broth microdilution methods for determining the susceptibilities of candida isolatesen_US
dc.typeArticle
dc.wos.quartileQ4en_US
dspace.entity.typePublication

Files

Original bundle

Now showing 1 - 1 of 1
Loading...
Thumbnail Image
Name:
Cilo_vd_2018.pdf
Size:
208.47 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:

License bundle

Now showing 1 - 1 of 1
No Thumbnail Available
Name:
license.txt
Size:
1.71 KB
Format:
Item-specific license agreed upon to submission
Description: